PTB – certifikace stád

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F19%3AN0000132" target="_blank" >RIV/00027162:_____/19:N0000132 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vri.cz/cz/vyzkum/aplikovane_vysledky/software" target="_blank" >https://www.vri.cz/cz/vyzkum/aplikovane_vysledky/software</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

PTB – certifikace stád

Popis výsledku v původním jazyce

Software pro webovou aplikaci „PTB – certifikace stád“ byl vyvinut za účelem vybudování národního systému on-line evidence výsledků vyšetření na paratuberkulózu skotu (PTB) u dobrovolně zapojených stád/hospodářství dojeného skotu a jejich kategorizace dle nákazového statusu (statusy A – D). Tento systém poslouží i k moderování procesu certifikace certifikační autoritou - Českomoravskou společností chovatelů, a. s. (ČMSCH, a. s.). Status hospodářství, resp. jeho pomocné podúrovně vyjadřující i jeho průběžný postup v certifikaci, může chovatel prezentovat/ nechat zpřístupnit všem uživatelům aplikace Přístup k datům – Internet pro chovatele ČMSCH, a. s., nebo i na běžném internetu. Aplikace PTB – certifikace stád je samostatnou nadstavbou webové aplikace (WA) Přístup k datům provozované ČMSCH, a. s., která je přístupná všem zaregistrovaným uživatelům, především chovatelům skotu, či jejich zástupcům. Technické parametry: Při vývoji webové aplikace PTB – certifikace stád byl použit čistý programovací a skriptovací jazyk PHP, databáze MySQL, značkovací jazyk HTML5, kaskádové styly CSS3 a skriptovací jazyk JavaScript. Aplikace je umístěna na platformě Apache (Linux) v rámci dedikovaného serveru ČMSCH, a. s. WA sestává ze dvou částí, uživatelské a administrační. Pro chovatele/uživatele byly v uživatelské části WA vytvořeny moduly Úvod, Výsledky (vyšetření vzorků), Upozornění (e-mailová, SMS e-mailová), Historie (dosažených statusů) a Nastavení cílů (cílových statusů PTB), Přehledy (postupu vlastních, všech zapojených hospodářství/chovatelů v certifikaci), Časté dotazy (a odpovědi) a Novinky a články. V administrační části byly vytvořeny moduly pro správu WA PTB – certifikace stád: 1) Laboratoře: správa autorizovaných laboratoří, které mají oprávnění dodávat data/výsledky vyšetření na PTB do WA, 2) Diagnózy: správa atributů typů výsledků/diagnóz PTB, 3) Import: přehled naimportovaných výsledků, 4) a 5) Časté dotazy a Novinky a články: správa stejnojmenných modulů na uživatelské části WA. WA zohledňuje a moderuje to, že všechny odběry pro certifikaci mají proběhnout v různých specifických lhůtách. WA přijímá, ukládá a následně zpracovává dle originálních algoritmů výsledky vyšetření I) směsných vzorků za celé stádo, pokud chovatel usiluje o dosažení a udržení statusu C a B. Pro status B do zpracovávání výsledků navíc vstupují možnosti opravných vyšetření po pozitivním výsledku či po překročení lhůty. II) V rámci úsilí chovatele o dosažení a udržení statusu A zpracovává WA výsledky vyšetření základních a konfirmačních individuálních vzorků. Do zpracovávání výsledků pro status A navíc vstupuje termínované vyřazování plemenic s pozitivním výsledkem základního nebo i konfirmačního vyšetření a jejich podíl ze všech povinně vyšetřených v rámci základních plošných odběrů. Propojení WA u individuálních výsledků vyšetření, resp. jejich odesílání i do sesterské webové aplikace Deník nemocí a léčení poskytuje chovateli možnost získat kompletní přehled o aktuálním zdravotním stavu jednotlivých zvířat ve svém stádě. Aplikace PTB – certifikace stád představuje klíčový nástroj pro naplnění uvedeného projektu, který si mj. klade za cíl přispět k omezení šíření PTB jak mezi chovy, tak uvnitř jednotlivých hospodářství a omezit tak v ČR vstup původce PTB do humánního potravinového řetězce.

Název v anglickém jazyce

Bovine paratuberculosis - herd certification

Popis výsledku anglicky

Software for Web Application "PTB – Herd Certification" was developed in order to establish a national system of on-line registration of results of bovine paratuberculosis (PTB) testing in dairy cattle herds/farms involved on a voluntary basis and their classification according to health status (status A – D) ). This system will also be used to manage the certification process by a certification authority – the Czech-Moravian Breeders' Association, a.s. (ČMSCH, a.s.) The farmers can present/make available the Farm status, or its auxiliary sublevels showing also its ongoing process of certification, to all users of the Data access application on the Internet for members of ČMSCH, a.s., or also on the regular Internet. The application "PTB – Herd Certification" is an independent extension of the Web Application (WA) Data access operated by ČMSCH, a.s., which is open to all registered users, especially to cattle breeders and their deputies. Technical parameters: During the development of the Web Application "PTB – Herd Certification", we used the pure programming and scripting PHP language, MySQL database, markup language HTML5, cascading styles CSS3 and scripting language JavaScript. The application is located on the Apache platform (Linux) within the dedicated server of ČMSCH, a.s. The Web Application consists of two parts: user and administration part. For breeders/users, the following modules were created in the user part of WA: Introduction, Results (sample testing results), Alerts (e-mail, SMS notifications), History (achieved statuses) and Goal setting (setting of target PTB statuses), Surveys (development of own ones, or for all farms/breeders), Frequently Asked Questions (and Answers) and News and Articles. In the administration part, modules for the administration of WA "PTB – Herd Certification" were created: (1) Laboratories: administration of accredited laboratories authorized to deliver data/results of PTB testing to WA, (2) Diagnoses: administration of attributes of types of results/PTB diagnoses, (3) Import: list of imported results, (4) and (5) Frequently Asked Questions and News and Articles: administration of modules of the same name in the user part of WA. The WA takes into account and monitors the fact that all samplings for certification should take place within different specific deadlines. WA receives, stores and then processes - according to original algorithms - test results of (I) whole-herd pooled samples, if the farmer strives to achieve and maintain status C and B. Moreover, for status B, re-testing is possible during processing of results after obtaining a positive result or after expiration of a deadline. (II) As part of the breeders' efforts to achieve and maintain status A, WA processes the results of testing of individual basic and confirmatory samples. Furthermore, during processing of results for status A, termed culling of cows with a positive result in basic or even confirmatory testing and their proportion out of all compulsorily tested cows during basic blanket sampling are included. Interconnection of the WA for individual testing results, i.e. sending them to the sister web application “Diary of diseases and treatments” gives the breeders an opportunity to get a complete overview of the current health status of individual animals in their herds. The application "PTB – Herd Certification" is a key tool for the accomplishment of this project, which aims, among others, to make a contribution to reducing the transmission of PTB both between and within herds, thus limiting the entry of the PTB agent into the human food chain.

Druh

R - Software

CEP obor

—

OECD FORD obor

40301 - Veterinary science

Projekt

<a href="/cs/project/QK1820086" target="_blank" >QK1820086: Paratuberkulóza – výskyt a certifikační program v chovech skotu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

Software 376/2020

Technické parametry

Systémové prostředí: Webová aplikace PTB – certifikace stád byla vyvinuta pomocí originálních algoritmů a postupů na míru požadavků zadavatele v čistém programovacím a skriptovacím jazyce PHP s využitím databáze MySQL, aniž by byl jako základ použit existující systém či softwarové nástroje třetích stran. Výjimkou je pouze propojení některých modulů s aplikací Přístup k datům, jako např. Správa uživatelů aplikace PTB. Aplikace je umístěna na platformě Apache (Linux) v rámci dedikovaného serveru společnosti ČMSCH, a. s. Originální algoritmy pro zpracování a výstup dat jsou vyvíjeny na platformě aktuální verze programovacího a skriptovacího jazyka PHP, která zajišťuje bezpečnost celé aplikace v podobě pravidelných bezpečnostních aktualizací. Při tvorbě aplikace byly dále použity: značkovací jazyk HTML5, kaskádové styly CSS3, databáze MySQL a skriptovací jazyk JavaScript. Systémové požadavky: Pro využívání aplikace PTB – certifikace stád je nutné být registrovaným uživatelem aplikace Přístup k datům společnosti ČMSCH, a. s. a dále je třeba splnit následující podmínky: přístup k síti Internet a aktuální verze internetového prohlížeče (Firefox, Chrome, Opera, Internet Explorer (Edge) apod.). Přístup do aplikace: Přístup do aplikace je umožněn pouze registrovaným uživatelům po zadání uživatelského jména a hesla na adrese aplikace Přístup k datům: https://data-demo.cmsch.cz/. Po úspěšném přihlášení je třeba vybrat v menu položku PTB. Před prvním vstoupením do aplikace PTB – certifikace stád chovatel musí potvrdit, že souhlasí s tím, že pořízená data mohou být dále anonymně využita v monitorování nákazové situace PTB v ČR a pro odhad promoření stád dojeného skotu v ČR, případně v souhrnných celostátních přehledech. Na úvodní stránce WA je pak trvale zobrazováno datum odsouhlasení podmínek použití aplikace PTB - certifikace stád.

Ekonomické parametry

V souladu se smlouvou uzavřenou mezi MZe ČR a VÚVeL bude software po skončení řešení projektu bezplatně předán k užívání chovatelům dojeného skotu v ČR, pro které ho bude spravovat ČMSCH a. s., organizace MZe pověřená plněním úkolů vyplývajících z ustanovení § 23 zákona č. 154/2000 Sb., (plemenářský zákon). Podle zákona č. 110/1997 Sb. O potravinách a zákona č. 154/2000 Sb. O šlechtění, plemenitbě a evidenci hospodářských zvířat ve znění pozdějších předpisů je ČMSCH právnická osoba pověřená ministerstvem k výkonu činností podle jednotlivých bodů § 23c. Jmenovitě podle odstavců 1 a 2 a §7 je povinna poskytovat chovatelům a oprávněným osobám údaje, zpracovávat, zveřejňovat a evidovat výsledky. V souladu s doporučením Rady vlády pro výzkum uvádíme, že ČMSCH nevytváří těmito činnostmi zisk, poskytuje široké chovatelské veřejnosti co nejobjektivnější údaje a vyhodnocením celostátních databází vytváří podklady pro prokázání kvality především plemenářské práce chovatelů.

IČO vlastníka výsledku

00027162

Název vlastníka

Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v. v. i.