Rychlá multiplexní analýza nukleových kyselin pro detekci bakteriálních agens za využití magnetických mikrosfér

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F19%3AN0000254" target="_blank" >RIV/00027162:_____/19:N0000254 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.rank.cz/files/sbornik-RANK-2019.pdf" target="_blank" >http://www.rank.cz/files/sbornik-RANK-2019.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Rychlá multiplexní analýza nukleových kyselin pro detekci bakteriálních agens za využití magnetických mikrosfér

Popis výsledku v původním jazyce

15. ročník konference RANK 2019, 6. a 7. února 2019 v prostorách hotelu Zlatá Štika v Pardubicích – přednáška. Včasná detekce bakteriálních biologických agens je důležitým faktorem z pohledu zajištění ochrany zdraví lidí, potravinových zdrojů, zvířat a prostředí. Pro tento účel slouží technologie xMAP, která je založena na principu Multiplexní Oligonukleotidové Ligace, v níž dojde k ligaci dvojice sond vzájemně sousedících na cílové DNA sekvenci. Pro každý marker v testu je designován jiný pár sond. Pomocí ligace se vytvoří templát pro následující PCR s použitím univerzálních primerů (MOL-PCR). Jeden z univerzálních primerů nese fluorescenční značku. Ve třetím kroku jsou produkty PCR hybridizovány s mikrosférami MagPlex-TAG (každý set mikrosfér s jiným barevným odstínem červené) pomocí TAG. TAG je krátká oligonukleotidová sekvence začleněná do markerově specifických sond a komplementární k anti-TAG připojenému na mikrosférách. Pro každý marker se v testu používá jiný TAG a jiná mikrosféra. Zařízení Luminex identifikuje mikrosféru na základě měření červené barvy a změří fluorescenční signál za účelem zjištění, zda byl PCR produkt hybridizován s anti-TAG na mikrosféře. Touto metodou je umožněna přímá detekce, identifikace, typizace a semi-kvantifikace až 50 patogenních biologických agens v jedné reakci. Podstatu a finální verzi experimentu by měl tvořit diagnostický panel pro identifikaci bakteriálních patogenů (např. Bacillus anthracis, Yersinia pestis, Brucella spp., Francisella tularensis aj.), které jsou především původci zoonóz a bývají zneužívány jako bioteroristická zbraň proti státům či skupině obyvatel.

Název v anglickém jazyce

Rapid multiplex analysis of nucleic acids for the detection of bacterial agents using magnetic microspheres

Popis výsledku anglicky

15th RANK 2019 Conference, 6th and 7th February 2019 at the Hotel Zlatá Štika in Pardubice – lecture. Early detection of bacterial biological agents is an important factor in ensuring the protection of human health, food resources, animals and the environment. For this purpose, the xMAP technology, which is based on the principle Multiplexed Oligonucleotide Ligation in which there is a pair of ligation probes adjacent to each other on the target DNA sequence. For each marker in the test, another pair of probes is designed. The ligation creates a template for the following PCR using universal primers (MOL-PCR). One of the universal primers carries a fluorescent label. In the third step, PCR products are hybridized with the MagPlex-TAG microspheres (each set of red-colored microspheres) by TAG. TAG is a short oligonucleotide sequence incorporated into marker-specific probes and is also complementary to anti-TAG attached to microspheres. For each marker, different TAGs and other microspheres are used in the assay. Luminex identifies the microsphere based on red color measurement and measures the fluorescence signal to determine whether the PCR product has been hybridized with anti-TAG on the microsphere. This method allows the direct detection, identification, typing and semi-quantification of up to 50 pathogenic biological agents in one single reaction. The principle and final version of the experiment should be a diagnostic panel for identification of bacterial pathogens (Bacillus anthracis, Yersinia pestis, Brucella spp., Francisella tularensis etc.), which are primarily zoonotic agents and are abused as a bioterrorist weapon against states or group of people.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

10606 - Microbiology

Projekt

<a href="/cs/project/VI20152020044" target="_blank" >VI20152020044: Multiplexní xMAP technologie pro komplexní detekci patogenních agens významných z pohledu zajištění ochrany zdraví lidí a zvířat</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů