Metoda PCR-RFLP pro rozlišení sérotypu 1/2 Streptococcus suis od sérotypu 2 a sérotypu 1 od sérotypu 14
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F20%3AN0000154" target="_blank" >RIV/00027162:_____/20:N0000154 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://www.vri.cz/wp-content/uploads/2021/01/VUVeL-Certifikovana_metodika-123-Matiasovic-Metoda_PCR-RFLP_pro_rozl_serotypu_12Streptococcus_suis_od_serotypu_2_a_serotypu_1_od_serotypu_14-final.pdf" target="_blank" >https://www.vri.cz/wp-content/uploads/2021/01/VUVeL-Certifikovana_metodika-123-Matiasovic-Metoda_PCR-RFLP_pro_rozl_serotypu_12Streptococcus_suis_od_serotypu_2_a_serotypu_1_od_serotypu_14-final.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Metoda PCR-RFLP pro rozlišení sérotypu 1/2 Streptococcus suis od sérotypu 2 a sérotypu 1 od sérotypu 14
Popis výsledku v původním jazyce
Metodika popisuje postup použitelný k odlišení sérotypu 1/2 od sérotypu 2 a sérotypu 1 od sérotypu 14 Streptococcus suis. Předpokládá předchozí identifikaci nerozlišených sérotypů 1/2, 2 a 1, 14 od ostatních sérotypů Streptococcus suis například multiplexní PCR reakcí (Liu et al. 2013; Kerdsin et al. 2014, Okura et al. 2014) nebo aglutinační reakcí. Metoda je založena na end-point polymerázové řetězové reakci, následném štěpení PCR produktu restrikční endonukleázou BstNI (PCR-RFLP) a vizualizaci produktů štěpení v agarózovém gelu.
Název v anglickém jazyce
PCR-RFLP method for resolution Streptococcus suis serotypes 2 and 1/2 and serotypes 1 and 14
Popis výsledku anglicky
"The methodology describes a procedure applicable to distinguish serotype 1/2 from serotype 2 and serotype 1 from serotype 14 of Streptococcus suis. It assumes prior identification of undifferentiated serotypes 1/2, 2 and 1, 14 from other serotypes of Streptococcus suis, for example by multiplex PCR reaction (Liu et al. 2013; Kerdsin et al. 2014, Okura et al. 2014) or agglutination reaction. The method is based on end-point polymerase chain reaction, subsequent digestion of the PCR product with restriction endonuclease BstNI (PCR-RFLP) and visualization of the cleavage products in an agarose gel. "
Klasifikace
Druh
N<sub>metC</sub> - Metodiky certifikované oprávněným orgánem
CEP obor
—
OECD FORD obor
10606 - Microbiology
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/QK1810193" target="_blank" >QK1810193: Moderní metody diagnostiky, terapie a prevence infekcí Streptococcus suis jako nástroj pro sestavování cílených kontrolních programů v chovech prasat</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
123/2020
Číslo předpisu
68562/2020-MZE-14152
Technické parametry
Cílem uplatnění metodiky je rozlišení sérotypu 1/2 Streptococcus suis od sérotypu 2 a sérotypu 1 od sérotypu 14.
Ekonomické parametry
Náklady na zavedení metodiky v laboratoři vybavené pro provádění PCR a gelové elektroforézy spočívají pouze v nákupu specifických reagencií, tj. primerů a restrikční endonukleázy, celkem přibližně 4000 Kč. Přímý ekonomický přínos spočívá v rozšíření služeb sérotypizace Streptococcussuis uživatelem metodiky. Nepřímý přínos spočívá v identifikaci sérotypů Streptococcus suis se zoonotickým potenciálem od ostatních sérotypů Streptococcus suis a možnosti uplatnění opatření k zabránění infekcí lidí.
Označení certifikačního orgánu
Státní zdravotní ústav, Šrobárova 49/48, Praha 100 00
Datum certifikace
—
Způsoby využití výsledku
B - Výsledek je využíván orgány státní nebo veřejné správy