Vývoj MOL-PCR s MAGPIX analýzou pro detekci patogenních kvasinek a prototék

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F21%3AN0000172" target="_blank" >RIV/00027162:_____/21:N0000172 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://msmd.bpp.cz/cs/odborny-program-98" target="_blank" >https://msmd.bpp.cz/cs/odborny-program-98</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Vývoj MOL-PCR s MAGPIX analýzou pro detekci patogenních kvasinek a prototék

Popis výsledku v původním jazyce

Nebakteriální infekce často postihují jedince s oslabenou imunitou. Zejména kvasinky a jednobuněčné eukaryotické řasy prototéka se mohou podílet na vzniku zánětlivých onemocnění kůže či orgánů lidí a zvířat. Vzhledem k podobnosti morfologie kolonií na běžných kultivačních médiích, mohou achlorofylní prototéka často připomínat kvasinky a navíc je mohou přerůstat rychleji rostoucí bakterie. Dochází tak k oddálení další identifikace. Rychlé rozpoznání a identifikace infekční agens je pro stav nakažených jedinců zásadní. Urychluje podání vhodné antifungální medikace a zamezuje nadměrnému užívání antibiotik a šíření rezistencí. Pro detekci a identifikaci kvasinek a prototék představujeme návrh nové metodiky založené na MOL-PCR (multiplexní oligonukleotidová ligace - polymerázová řetězová reakce) s MAGPIX analýzou (detekce na bázi magnetických částic), vyvíjené a testované na kravském mléce. V letech 2019-2020 byly na základě kultivačních vyšetření mléka jednotlivých dojnic z různých farem určeny nejčetnější druhy kvasinek a prototék: Candida albicans, P. kudriavzevii, C. tropicalis, K. marxianus, C. inconspicua, Pichia fermentans, Yarrowia lipolytica, Prototheca bovis a Prot. blashkeae, Prot. ciferrii. Právě tyto agens bude moct nový detekční panel rychle a spolehlivě identifikovat, a to současně v jedné multiplexní reakci.

Název v anglickém jazyce

MOL-PCR and MAGPIX detection of pathogenic yeast and prototheca

Popis výsledku anglicky

Non-bacterial infections often affect immunocompromised individuals. In particular, yeast and unicellular eukaryotic algae prototheca may be involved in the development of inflammatory diseases of the skin or organs of humans and animals. Due to the similarity of colony morphology on common culture media, the achlorophyll prototheca can often resemble yeast and, in addition, can be overgrown by faster-growing bacteria. This delays further identification. Rapid recognition and identification of the infectious agent is essential for the condition of infected individuals. It accelerates the administration of appropriate antifungal medication and prevents excessive use of antibiotics and the spread of antibiotic resistance. For the detection and identification of yeasts and prototheca, we present a proposal for a new methodology based on MOL-PCR (multiplex oligonucleotide ligation - polymerase chain reaction) with MAGPIX analysis (detection based on magnetic particles), developed and tested on cow's milk. In the years 2019-2020, on the basis of culture examinations of milk of individual dairy cows from different farms, the most numerous species of yeasts and prototheca were determined: Candida albicans, P. kudriavzevii, C. tropicalis, K. marxianus, C. inconspicua, Pichia fermentans, Yarrowia lipolytica, Prototheca bovis and Prot. blashkeae, Prot. ciferrii. The new detection panel is able to quickly and reliably identify these agents simultaneously in one multiplex reaction.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

40301 - Veterinary science

Projekt

<a href="/cs/project/QK1910092" target="_blank" >QK1910092: Nebakteriální původci mastitid a jejich vliv na kvalitu a technologické vlastnosti mléka</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů