Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Genome-wide scan of long noncoding RNA single nucleotide polymorphisms and pancreatic cancer susceptibility

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00064173%3A_____%2F20%3AN0000007" target="_blank" >RIV/00064173:_____/20:N0000007 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68378041:_____/21:00552048 RIV/00216208:11140/21:10422537 RIV/00216208:11120/21:43921104 RIV/00216208:11110/21:10422537 RIV/00098892:_____/21:N0000105

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1002/ijc.33475" target="_blank" >https://doi.org/10.1002/ijc.33475</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/ijc.33475" target="_blank" >10.1002/ijc.33475</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Genome-wide scan of long noncoding RNA single nucleotide polymorphisms and pancreatic cancer susceptibility

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is projected to become the second cancer-related cause of death by 2030. Identifying novel risk factors, including genetic risk loci, could be instrumental in risk stratification and implementation of prevention strategies. Long noncoding RNAs (lncRNAs) are involved in regulation of key biological processes, and the possible role of their genetic variability has been unexplored so far. Combining genome wide association studies and functional data, we investigated the genetic variability in all lncRNAs. We analyzed 9893 PDAC cases and 9969 controls and identified a genome-wide significant association between the rs7046076 SNP and risk of developing PDAC (P = 9.73 x 10(-9) ). This SNP is located in the NONHSAG053086.2 (lnc-SMC2-1) gene and the risk allele is predicted to disrupt the binding of the lncRNA with the micro-RNA (miRNA) hsa-mir-1256 that regulates several genes involved in cell cycle, such as CDKN2B. The CDKN2B region is pleiotropic and its genetic variants have been associated with several human diseases, possibly though an imperfect interaction between lncRNA and miRNA. We present a novel PDAC risk locus, supported by a genome-wide statistical significance and a plausible biological mechanism.

  • Název v anglickém jazyce

    Genome-wide scan of long noncoding RNA single nucleotide polymorphisms and pancreatic cancer susceptibility

  • Popis výsledku anglicky

    Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is projected to become the second cancer-related cause of death by 2030. Identifying novel risk factors, including genetic risk loci, could be instrumental in risk stratification and implementation of prevention strategies. Long noncoding RNAs (lncRNAs) are involved in regulation of key biological processes, and the possible role of their genetic variability has been unexplored so far. Combining genome wide association studies and functional data, we investigated the genetic variability in all lncRNAs. We analyzed 9893 PDAC cases and 9969 controls and identified a genome-wide significant association between the rs7046076 SNP and risk of developing PDAC (P = 9.73 x 10(-9) ). This SNP is located in the NONHSAG053086.2 (lnc-SMC2-1) gene and the risk allele is predicted to disrupt the binding of the lncRNA with the micro-RNA (miRNA) hsa-mir-1256 that regulates several genes involved in cell cycle, such as CDKN2B. The CDKN2B region is pleiotropic and its genetic variants have been associated with several human diseases, possibly though an imperfect interaction between lncRNA and miRNA. We present a novel PDAC risk locus, supported by a genome-wide statistical significance and a plausible biological mechanism.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30204 - Oncology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    International Journal of Cancer

  • ISSN

    0020-7136

  • e-ISSN

    1097-0215

  • Svazek periodika

    148

  • Číslo periodika v rámci svazku

    11

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    2779-2788

  • Kód UT WoS článku

    000614216300001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85100380577