Rezistence bakteriálních agens izolovaných z dolních cest dýchacích pacientů v intenzivní péči a jejich klonalita v pocovidovém období

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00098892%3A_____%2F23%3A10158378" target="_blank" >RIV/00098892:_____/23:10158378 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/61989592:15110/23:73623450

Výsledek na webu

<a href="https://trios.cz/odborne-casopisy/kmil/" target="_blank" >https://trios.cz/odborne-casopisy/kmil/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Rezistence bakteriálních agens izolovaných z dolních cest dýchacích pacientů v intenzivní péči a jejich klonalita v pocovidovém období

Popis výsledku v původním jazyce

Cil práce: Období pandemie covid-19 výrazně ovlivnilo zdravotnický systém, včetně dopadu na dodržování principů racionální antibiotické politiky, zejména v souvislosti s nozokomiálními pneumoniemi, kdy bylo velmi obtížné odlišit případnou bakteriální i superinfekci od závažné zánětlivé reakce vyvolané virem SARS-CoV-2. Cílem předložené studie byla analýza antimikrobiální rezistence bakteriálních agens izolovaných z dolních cest dýchacích a jejich klonality u pacientů v intenzivní péči v roce 2022 a porovnání s předchozím covidovým obdobím. Materiál a metody: Do studie byly zahrnuty bakteriální kmeny izolované z dolních cest dýchacích (DCD) pacientů hospitalizovaných na Klinice anesteziologie, resuscitace a intenzivní medicíny Fakultní nemocnice Olomouc (KARIM) v období tří let (1. 1. 2020 až 31. 12. 2022). Citlivost k antibiotikům byla stanovena standardní diluční mikrometodou podle kritérií EUCAST, u vybraných izolátů bylo provedeno porovnání pomocí pulzní gelové elektroforézy (PFGE). Výsledky: Rezistence nejčastějších bakteriálních agens izolovaných z DCD pacientů hospitalizovaných na KARIM se během covidového (2020–2021) a pocovidového (2022) období výrazně nezměnila, s výjimkou Serratia marcescens a Enterococcus faecium. Tato dvě species vykázala nárůst počtu kmenů během pandemie covid-19 a rovněž významný vzestup podílu rezistentních kmenů. V případě Serratia marcescens došlo k následnému poklesu počtu izolátů i jejich rezistence v roce 2022. V případě Enterococcus faecium celkový počet izolátů rovněž významně klesl, ale četnost vankomycin-rezistentních izolátů (VRE) se nadále zvyšovala. V období pandemie covid-19 lze zvýšený záchyt VRE spojit s klonálním šířením, v roce 2022 se však výrazná klonalita již nepotvrdila. Porovnání podobnosti pomocí PFGE u dalších bakteriálních druhů rovněž neodhalilo významnější horizontální přenos mezi pacienty v pocovidovém období, neboť většina izolátů (85 %) vykazovala jedinečný restrikční profil. Závěr: Výsledky naznačuji, že frekvence i antimikrobiální rezistence většiny nejčastějších bakteriálních agens z dolních cest dýchacích pacientů hospitalizovaných na KARIM v pocovidovém období zůstává srovnatelná s dobou před propuknutím pandemie covid-19 i během ní. Výjimkou je druh Enterococcus faecium, u něhož došlo k nárůstu rezistence k vankomycinu v covidovém i pocovidovém období.

Název v anglickém jazyce

Resistance of bacterial pathogens isolated from the lower respiratory tract and their clonality in intensive care patients in a post-COVID-19 period

Popis výsledku anglicky

Objectives: The period of the COVID-19 pandemic had a significant impact on the healthcare system, including its effect on compliance with the established procedures of a rational antibiotic policy, especially in the context of nosocomial pneumonia, where it was very difficult to distinguish a possible bacterial superinfection from a severe inflammatory reaction caused by the SARS-CoV-2 virus. The aim of the present study was to analyze the antimicrobial resistance of bacterial pathogens isolated from the lower respiratory tract and their clonality in intensive care patients in 2022 and to compare it with the previous COVID-19 period. Material and Methods: Bacterial strains isolated from the lower respiratory tract (LRT) of patients hospitalized at the Department of Anaesthesiology, Resuscitation and Intensive Care, Olomouc University Hospital (DARIC) over a three-year period (January 1, 2020 – December 31, 2022) were included in the study. The susceptibility to antibiotics was determined by the standard microdilution method according to the EUCAST criteria, and selected isolates were compared using pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). Results: The resistance of the most common bacterial pathogens isolated from the LRT of patients hospitalized at DARIC did not change significantly during the COVID-19 (20203–2021) and post-COVID-19 (2022) periods, with the exception of Serratia marcescens and Enterococcus faecium species. These two showed an increase in the number of strains during the COVID-19 pandemic, as well as a significant increase in the proportion of resistant strains. In the case of Serratia marcescens, there was a subsequent decrease in the number of isolates and their resistance in 2022. For Enterococcus faecium, the total number of isolates also decreased significantly, but the frequency of vancomycin-resistant isolates (VRE) continued to increase. During the COVID-19 pandemic, increased VRE detection can be linked to proven clonal spread, but significant clonality was no longer confirmed in 2022. Comparison of similarity by PFGE in other bacterial species also did not reveal significant horizontal transmission between patients in the post-COVID-19 period, as most isolates (85%) showed a unique restriction profile. Conclusions: The results indicate that the frequency and antimicrobial resistance of the majority of the most common bacterial pathogens from the LRT of patients hospitalized at DARIC in the post-pandemic period remain comparable to the time before and during the COVID-19 pandemic outbreak. An exception is Enterococcus faecium, which showed an increase in vancomycin resistance in both the COVID-19 and the post-COVID-19 periods.

Druh

J_SC - Článek v periodiku v databázi SCOPUS

CEP obor

—

OECD FORD obor

10606 - Microbiology

Projekt

<a href="/cs/project/NU22-B-112" target="_blank" >NU22-B-112: Management antibiotické léčby u pacientů s kritickým stupněm Covid-19</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Klinická mikrobiologie a infekční lékařství

ISSN

1211-264X

e-ISSN

—

Svazek periodika

29

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

4-10

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85168249751