Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Relationship of Bacteria Using Comparison of Whole Genome Sequences in Frequency Domain

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00159816%3A_____%2F14%3A00063518" target="_blank" >RIV/00159816:_____/14:00063518 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216305:26220/14:PU109324

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-06593-9" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-06593-9</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-06593-9" target="_blank" >10.1007/978-3-319-06593-9</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Relationship of Bacteria Using Comparison of Whole Genome Sequences in Frequency Domain

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Developing sequencing techniques provide understanding the molecular phylogeny at the whole genome level. The phylogeny derived from 16S rRNA gene is the universally accepted DNA sequence-based method today; so far there is no widely accepted approach toinfer phylogenetic relationships from complete genome data. If the entire genome is used, the data reflect organismal evolution, not the evolution on a single gene level. We propose a new method for determination of relationship of bacteria based on whole genome data. The method compares whole genomic DNA sequences in frequency domain. The proposed method was tested on phyla level on 168 bacteria from four phyla and on order level - 121 bacteria from phylum Proteobacteria, class Gammaproteobacteria were classified. The classification on both levels was successful in more than 82%.

  • Název v anglickém jazyce

    Relationship of Bacteria Using Comparison of Whole Genome Sequences in Frequency Domain

  • Popis výsledku anglicky

    Developing sequencing techniques provide understanding the molecular phylogeny at the whole genome level. The phylogeny derived from 16S rRNA gene is the universally accepted DNA sequence-based method today; so far there is no widely accepted approach toinfer phylogenetic relationships from complete genome data. If the entire genome is used, the data reflect organismal evolution, not the evolution on a single gene level. We propose a new method for determination of relationship of bacteria based on whole genome data. The method compares whole genomic DNA sequences in frequency domain. The proposed method was tested on phyla level on 168 bacteria from four phyla and on order level - 121 bacteria from phylum Proteobacteria, class Gammaproteobacteria were classified. The classification on both levels was successful in more than 82%.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Advances in Intelligent Systems and Computing

  • ISSN

    2194-5357

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    283

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2014

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    12

  • Strana od-do

    397-408

  • Kód UT WoS článku

    000352133800036

  • EID výsledku v databázi Scopus