Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Ancestral Haloalkane Dehalogenases Show Robustness and Unique Substrate Specificity

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00159816%3A_____%2F17%3A00067125" target="_blank" >RIV/00159816:_____/17:00067125 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216224:14310/17:00095408

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/cbic.201700197" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1002/cbic.201700197</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/cbic.201700197" target="_blank" >10.1002/cbic.201700197</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Ancestral Haloalkane Dehalogenases Show Robustness and Unique Substrate Specificity

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Ancestral sequence reconstruction (ASR) represents a powerful approach for empirical testing structure-function relationships of diverse proteins. We employed ASR to predict sequences of five ancestral haloalkane dehalogenases (HLDs) from the HLD-II subfamily. Genes encoding the inferred ancestral sequences were synthesized and expressed in Escherichia coli, and the resurrected ancestral enzymes (AncHLD1-5) were experimentally characterized. Strikingly, the ancestral HLDs exhibited significantly enhanced thermodynamic stability compared to extant enzymes (Delta T-m up to 24 degrees C), as well as higher specific activities with preference for short multi-substituted halogenated substrates. Moreover, multivariate statistical analysis revealed a shift in the substrate specificity profiles of AncHLD1 and AncHLD2. This is extremely difficult to achieve by rational protein engineering. The study highlights that ASR is an efficient approach for the development of novel biocatalysts and robust templates for directed evolution.

  • Název v anglickém jazyce

    Ancestral Haloalkane Dehalogenases Show Robustness and Unique Substrate Specificity

  • Popis výsledku anglicky

    Ancestral sequence reconstruction (ASR) represents a powerful approach for empirical testing structure-function relationships of diverse proteins. We employed ASR to predict sequences of five ancestral haloalkane dehalogenases (HLDs) from the HLD-II subfamily. Genes encoding the inferred ancestral sequences were synthesized and expressed in Escherichia coli, and the resurrected ancestral enzymes (AncHLD1-5) were experimentally characterized. Strikingly, the ancestral HLDs exhibited significantly enhanced thermodynamic stability compared to extant enzymes (Delta T-m up to 24 degrees C), as well as higher specific activities with preference for short multi-substituted halogenated substrates. Moreover, multivariate statistical analysis revealed a shift in the substrate specificity profiles of AncHLD1 and AncHLD2. This is extremely difficult to achieve by rational protein engineering. The study highlights that ASR is an efficient approach for the development of novel biocatalysts and robust templates for directed evolution.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2017

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    ChemBioChem

  • ISSN

    1439-4227

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    18

  • Číslo periodika v rámci svazku

    14

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    1448-1456

  • Kód UT WoS článku

    000405726100015

  • EID výsledku v databázi Scopus