LoopGrafter 1.0

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00159816%3A_____%2F23%3A00079803" target="_blank" >RIV/00159816:_____/23:00079803 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

LoopGrafter 1.0

Popis výsledku v původním jazyce

Webový nástroj LoopGrafter pomáhá identifikovat a vyhodnocovat potenciální kandidáty za účelem zlepšení vlastností proteinů transplantací smyček z jednoho proteinu do druhého. Nástroj používá jako vstup struktury dvou homologních proteinů a krok za krokem uživatelům pomáhá s identifikací a vyhodnocením kandidátů na smyčkový přenos. Tento nástroj dokáže posoudit flexibilitu a dynamiku proteinů pomocí modelů elastických sítí a může generovat 3D modely upravených proteinů.

Název v anglickém jazyce

LoopGrafter 1.0

Popis výsledku anglicky

A web-based tool LoopGrafter helps with the identification and evaluation of potential loop grafting candidates to improve the properties of proteins by transplanting loops from one protein to another. The tool takes as input the structures of two homologous proteins and provides a step-by-step guide for users to identify and evaluate loop grafting candidates. The tool can assess the flexibility and dynamics of the proteins using elastic network models, and it can generate 3D models of the grafted proteins.

Druh

R - Software

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

<a href="/cs/project/LM2023055" target="_blank" >LM2023055: Česká národní infrastruktura pro biologická data</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

SW_5_2023

Technické parametry

V budoucnu je plánována komerční nabídka potencionálním partnerům z komerční sféry.

Ekonomické parametry

Doposud je využíváno interně k výzkumným účelům.

IČO vlastníka výsledku

00159816

Název vlastníka

Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně