Moldina: molekulární dokování více ligandů přes AutoDock Vina

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00159816%3A_____%2F24%3A00081662" target="_blank" >RIV/00159816:_____/24:00081662 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://opencode.it4i.eu/permed/moldina-multiple-ligand-molecular-docking-over-autodock-vina" target="_blank" >https://opencode.it4i.eu/permed/moldina-multiple-ligand-molecular-docking-over-autodock-vina</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Moldina: molekulární dokování více ligandů přes AutoDock Vina

Popis výsledku v původním jazyce

Algoritmus je postaven na frameworku AutoDock Vina začleněním optimalizace pomocí roje částic. Program slouží pro simultánní dokování více ligandů do proteinu. Díky této modifikaci software vykazuje srovnatelnou přesnost predikcí vazebných konformací ligandu, přičemž významně zkrátil výpočetní čas. Software představuje rozšíření stávajícího programu AutoDock Vina o možnost simultanního dokování více ligandů do proteinu optimalizací rojem částic. Software je psaný v jazyce C++.

Název v anglickém jazyce

Moldina: Multiple Ligand Molecular Docking over AutoDock Vina

Popis výsledku anglicky

The algorithm is built on the AutoDock Vina framework by incorporating particle swarm optimization. The program is used for simultaneously docking multiple ligands into a protein. With this modification, the software exhibits comparable accuracy in predicting ligand binding conformations while significantly reducing computational time. The software extends the existing AutoDock Vina program to allow simultaneous docking of multiple ligands to a protein by particle swarm optimization. The software is written in C++.

Druh

R - Software

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

<a href="/cs/project/TN01000013" target="_blank" >TN01000013: Personalizovaná medicína - diagnostika a terapie</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2024

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

SW_5_2024

Technické parametry

Doposud je využíváno interně oběma subjekty k výzkumným účelům.

Ekonomické parametry

V budoucnu je plánována nabídka potencionálním partnerům z komerční sféry.

IČO vlastníka výsledku

00159816

Název vlastníka

Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně a IT4Innovations národní superpočítačové centrum (50:50%)