Využití jednokapilárového obousměrného sekvenování pro genotypizaci TGF?1 genu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00179906%3A_____%2F13%3A10173989" target="_blank" >RIV/00179906:_____/13:10173989 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216208:11150/13:10173989

Výsledek na webu

<a href="http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2013_11_880-884.pdf" target="_blank" >http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2013_11_880-884.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Využití jednokapilárového obousměrného sekvenování pro genotypizaci TGF?1 genu

Popis výsledku v původním jazyce

Ve studii prezentujeme metodu jednokapilárové elektroforézy při verifikaci obousměrné sekvenační analýzy pro genetický polymorfismus -1552delAGG v genu TGFB1. Pro verifikaci byla použita sekvenační reakce s forward a reverzními primery modifikovanými na5'- koncích adaptery složenými z 55 (forvard primer) a 10 (reverzní primer) repeticemi cytosinu a adeninu (CA adaptéry). Ty umožnily kompletní čtení obou vláken amplikonu a definovat rozdílný migrační čas obou fragmentů při kapilární elektroforéze. Studie ukázala, že připojení CA adaptérů k primerům umožňuje provést sekvenování obou vláken amplikonu v jedné reakční zkumavce a separovat obě vlákna v jediné kapiláře.

Název v anglickém jazyce

Using a Single-Capillary Bidirectional Sequencing for Genotyping the TGFB1 Gene

Popis výsledku anglicky

A novel single-capillary method of verification of both-strand analysis of the -1552delAGG genetic polymorphism in the TGFB1 gene is presented. For the verification we used the single-tube sequencing reaction with forward and reverse primers modified atthe 5'-end by adapters composed of 55 (forward primer) and 10 (reverse primer) repetitive units of cytosine and adenine (CA adapters). The CA adapters made it possible to get complete readings (of both strands of the amplicons) and to determine differentmigration times for forward and reverse sequencing fragments in single-capillary electrophoresis. Our study showed that the attachment of the CA adapters to the primers made it possible to perform sequencing of both strands in one PCR tube as well as toseparate forward and reverse sequencing fragments in one capillary.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/NT11334" target="_blank" >NT11334: Genetická predikce pozdní toxicity radioterapie cervikálního karcinomu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemické listy

ISSN

0009-2770

e-ISSN

—

Svazek periodika

107

Číslo periodika v rámci svazku

11

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

880-884

Kód UT WoS článku

000328730000009

EID výsledku v databázi Scopus

—