Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

A stationary phase with a positively charged surface allows for minimizing formic acid concentration in the mobile phase, enhancing electrospray ionization in LC-MS proteomic experiments

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00179906%3A_____%2F23%3A10471667" target="_blank" >RIV/00179906:_____/23:10471667 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11160/23:10471667

  • Výsledek na webu

    <a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=7w9GSp7Hfv" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=7w9GSp7Hfv</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1039/d3an01508d" target="_blank" >10.1039/d3an01508d</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    A stationary phase with a positively charged surface allows for minimizing formic acid concentration in the mobile phase, enhancing electrospray ionization in LC-MS proteomic experiments

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The default choice of mobile phase acidifier for bottom-up LC-MS proteomic analyses is 0.10% formic acid because of its decent acidity, decent ion pairing ability, and low suppression of electrospray ionization. In recent years, state-of-the-art columns have been designed specifically to provide efficient separation even when using an MS-friendly mobile phase of low ionic strength. Despite this, no attempts have been made to improve the sensitivity of the MS-based analytical methods by reducing the amount of formic acid in the mobile phase. In this study, we evaluated the effect of reduced formic acid concentration in the mobile phase on the chromatographic behavior and MS response of peptides when separated using columns packed with a C18 stationary phase with a positively charged surface. Using 0.01% formic acid in the mobile phase maintained excellent chromatographic performance and increased MS signal response compared to the standard of 0.10%. The enhanced MS response translated to about 50% improved peptide identifications depending on the complexity and amount of sample injected. The increased retention of peptides at a reduced formic acid concentration was directly proportional to the number of acidic residues in the peptide sequence. The study was carried out by covering a spectrum of protein samples with varied complexity using analytical flow, micro-, and nanoflow regimes to expand the applicability in routine practice.

  • Název v anglickém jazyce

    A stationary phase with a positively charged surface allows for minimizing formic acid concentration in the mobile phase, enhancing electrospray ionization in LC-MS proteomic experiments

  • Popis výsledku anglicky

    The default choice of mobile phase acidifier for bottom-up LC-MS proteomic analyses is 0.10% formic acid because of its decent acidity, decent ion pairing ability, and low suppression of electrospray ionization. In recent years, state-of-the-art columns have been designed specifically to provide efficient separation even when using an MS-friendly mobile phase of low ionic strength. Despite this, no attempts have been made to improve the sensitivity of the MS-based analytical methods by reducing the amount of formic acid in the mobile phase. In this study, we evaluated the effect of reduced formic acid concentration in the mobile phase on the chromatographic behavior and MS response of peptides when separated using columns packed with a C18 stationary phase with a positively charged surface. Using 0.01% formic acid in the mobile phase maintained excellent chromatographic performance and increased MS signal response compared to the standard of 0.10%. The enhanced MS response translated to about 50% improved peptide identifications depending on the complexity and amount of sample injected. The increased retention of peptides at a reduced formic acid concentration was directly proportional to the number of acidic residues in the peptide sequence. The study was carried out by covering a spectrum of protein samples with varied complexity using analytical flow, micro-, and nanoflow regimes to expand the applicability in routine practice.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30104 - Pharmacology and pharmacy

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA22-21620S" target="_blank" >GA22-21620S: Minimalizace a potencionální využití negativních vlivů vysoké teploty kolony a mobilní fáze v proteomických analýzách</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    The Analyst

  • ISSN

    0003-2654

  • e-ISSN

    1364-5528

  • Svazek periodika

    148

  • Číslo periodika v rámci svazku

    23

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

    5980-5990

  • Kód UT WoS článku

    001090805900001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85175240804