Generation of a CHIP isogenic human iPSCderived cortical neuron model for functional proteomics
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00209805%3A_____%2F22%3A00079118" target="_blank" >RIV/00209805:_____/22:00079118 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35391935/" target="_blank" >https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35391935/</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.xpro.2022.101247" target="_blank" >10.1016/j.xpro.2022.101247</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Generation of a CHIP isogenic human iPSCderived cortical neuron model for functional proteomics
Popis výsledku v původním jazyce
The neuroprotective E3-ubiquitin ligase CHIP is linked to healthy aging. Here, we present a protocol using a patient-derived iPSC line with a triplication of the a-synuclein gene to produce gene-edited cells isogenic for CHIP. We describe iPSC differentiation into cortical neurons and their identity validation. We then detail mass spectrometry-based approaches (SWATH-MS) to identify dominant changes in the steady state proteome generated by loss of CHIP function. This protocol can be adapted to other proteins that impact proteostasis in neurons.
Název v anglickém jazyce
Generation of a CHIP isogenic human iPSCderived cortical neuron model for functional proteomics
Popis výsledku anglicky
The neuroprotective E3-ubiquitin ligase CHIP is linked to healthy aging. Here, we present a protocol using a patient-derived iPSC line with a triplication of the a-synuclein gene to produce gene-edited cells isogenic for CHIP. We describe iPSC differentiation into cortical neurons and their identity validation. We then detail mass spectrometry-based approaches (SWATH-MS) to identify dominant changes in the steady state proteome generated by loss of CHIP function. This protocol can be adapted to other proteins that impact proteostasis in neurons.
Klasifikace
Druh
J<sub>SC</sub> - Článek v periodiku v databázi SCOPUS
CEP obor
—
OECD FORD obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2022
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
STAR Protocols
ISSN
2666-1667
e-ISSN
2666-1667
Svazek periodika
3
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
33
Strana od-do
101247
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85127487622