A benchmark for comparison of cell tracking algorithms
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F14%3A10284273" target="_blank" >RIV/00216208:11110/14:10284273 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216224:14330/14:00073448
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu080" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu080</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu080" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/btu080</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
A benchmark for comparison of cell tracking algorithms
Popis výsledku v původním jazyce
Motivation: Automatic tracking of cells in multidimensional time-lapse fluorescence microscopy is an important task in many biomedical applications. A novel framework for objective evaluation of cell tracking algorithms has been established under the auspices of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2013 Cell Tracking Challenge. In this article, we present the logistics, datasets, methods and results of the challenge and lay down the principles for future uses of this benchmark. Results: The main contributions of the challenge include the creation of a comprehensive video dataset repository and the definition of objective measures for comparison and ranking of the algorithms. With this benchmark, six algorithms covering a variety of segmentation and tracking paradigms have been compared and ranked based on their performance on both synthetic and real datasets. Given the diversity of the datasets, we do not declare a single winner of the challenge. Instead, we present a
Název v anglickém jazyce
A benchmark for comparison of cell tracking algorithms
Popis výsledku anglicky
Motivation: Automatic tracking of cells in multidimensional time-lapse fluorescence microscopy is an important task in many biomedical applications. A novel framework for objective evaluation of cell tracking algorithms has been established under the auspices of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2013 Cell Tracking Challenge. In this article, we present the logistics, datasets, methods and results of the challenge and lay down the principles for future uses of this benchmark. Results: The main contributions of the challenge include the creation of a comprehensive video dataset repository and the definition of objective measures for comparison and ranking of the algorithms. With this benchmark, six algorithms covering a variety of segmentation and tracking paradigms have been compared and ranked based on their performance on both synthetic and real datasets. Given the diversity of the datasets, we do not declare a single winner of the challenge. Instead, we present a
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EA - Morfologické obory a cytologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Bioinformatics
ISSN
1367-4803
e-ISSN
—
Svazek periodika
30
Číslo periodika v rámci svazku
11
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
1609-1617
Kód UT WoS článku
000337040200016
EID výsledku v databázi Scopus
—