Colorectal cancer risk and patients' survival: influence of polymorphisms in genes somatically mutated in colorectal tumors
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F14%3A10284384" target="_blank" >RIV/00216208:11110/14:10284384 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68378041:_____/14:00430205 RIV/00064165:_____/14:10284384
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s10552-014-0379-1" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/s10552-014-0379-1</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s10552-014-0379-1" target="_blank" >10.1007/s10552-014-0379-1</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Colorectal cancer risk and patients' survival: influence of polymorphisms in genes somatically mutated in colorectal tumors
Popis výsledku v původním jazyce
The first two studies aiming for the high-throughput identification of the somatic mutation spectrum of colorectal cancer (CRC) tumors were published in 2006 and 2007. Using exome sequencing, they described 69 and 140 candidate cancer genes (CAN genes),respectively. We hypothesized that germline variants in these genes may influence CRC risk, similar to APC, which is causing CRC through germline and somatic mutations. After excluding the well-established CRC genes APC, KRAS, TP53, and ABCA1, we analyzed 35 potentially functional single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in 10 CAN genes (OBSCN, MLL3, PKHD1, SYNE1, ERCC6, FBXW7, EPHB6/TRPV6, ELAC1/SMAD4, EPHA3, and ADAMTSL3) using KBiosciences Competitive AlleleaEuroSpecific PCR (TM) genotyping assays. Inaddition to CRC risk (1,399 CRC cases, 838 controls), we also considered the influence of the SNPs on patients' survival (406 cases). In spite of the fact that our in silico analyses suggested functional relevance for the studied genes an
Název v anglickém jazyce
Colorectal cancer risk and patients' survival: influence of polymorphisms in genes somatically mutated in colorectal tumors
Popis výsledku anglicky
The first two studies aiming for the high-throughput identification of the somatic mutation spectrum of colorectal cancer (CRC) tumors were published in 2006 and 2007. Using exome sequencing, they described 69 and 140 candidate cancer genes (CAN genes),respectively. We hypothesized that germline variants in these genes may influence CRC risk, similar to APC, which is causing CRC through germline and somatic mutations. After excluding the well-established CRC genes APC, KRAS, TP53, and ABCA1, we analyzed 35 potentially functional single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in 10 CAN genes (OBSCN, MLL3, PKHD1, SYNE1, ERCC6, FBXW7, EPHB6/TRPV6, ELAC1/SMAD4, EPHA3, and ADAMTSL3) using KBiosciences Competitive AlleleaEuroSpecific PCR (TM) genotyping assays. Inaddition to CRC risk (1,399 CRC cases, 838 controls), we also considered the influence of the SNPs on patients' survival (406 cases). In spite of the fact that our in silico analyses suggested functional relevance for the studied genes an
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Cancer Causes and Control
ISSN
0957-5243
e-ISSN
—
Svazek periodika
25
Číslo periodika v rámci svazku
6
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
759-769
Kód UT WoS článku
000336023600011
EID výsledku v databázi Scopus
—