Molekulární senzor pro orientační stanovení epigenetických markerů na bázi supramolekulárních polymerů ve vodných fyziologických systémech

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F17%3A10373393" target="_blank" >RIV/00216208:11110/17:10373393 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Molekulární senzor pro orientační stanovení epigenetických markerů na bázi supramolekulárních polymerů ve vodných fyziologických systémech

Popis výsledku v původním jazyce

Podstatou technického řešení molekulárního senzoru pro orientační stanovení epigenetických markerů na bází supramolekulárních polymerů ve vodných fyziologických systémech spočívá na kvantitativním spektroskopickém stanovení UV/Vis či fluorescence. Principem je interakce methylovaných oligonukleotidů DNA s chelátorem na bázi derivátu sacharinu za vzniku supramolekulárniho polymeru v pufrovaném vodném roztoku s chrakterristickou spektrální změnou. Funkční vzorek je zejména tvořen srovnávací sadou 5 fluorescenčních kyvet (o délce strany 1 cm z plastu). Do každé kyvety je přidán malý přídavek cca 25 uL koncentrovaného roztoku chelátoru, k němu je přikápnut 25 uL koncentrovaného roztoku příslušného kovového iontu ve vodě. Po promíchání obou roztoků, je přidán roztok obsahující vzorek a objem kyvety je doplněn na 2,4 ml. Daný vzorek je tedy analyticky srovnán pomocí pěti různých supramolekulárních polymerů. Naměřená spektra jsou následně porovnána s knihovnou naměřených standardů. A finálním vyhodnocení je provedena statistickými metodami.

Název v anglickém jazyce

Molecular sensor for orientative determination of epigenetic markers based on supramolecular polymers in aqueous physiological systems

Popis výsledku anglicky

The principle of a molecular sensor technical solution for the orientative determination of epigenetic markers on the basis of supramolecular polymers in aqueous physiological systems is based on quantitative spectroscopic determination of UV / Vis or fluorescence. The principle is the interaction of methylated oligonucleotides with a chelate based on a saccharin derivative to form a supramolecular polymer in a buffered aqueous solution with a chrakterristic spectral change. The functional sample consists, in particular, of a 5-fluorescence cuvette (1 cm long side of plastic). A small addition of about 25 μL of a concentrated chelator solution is added to each cuvette and 25 μL of a concentrated metal ion solution in water is added thereto. After mixing the two solutions, a solution containing the sample is added and the cell volume is added to 2.4 ml. The sample is therefore analyzed analytically by five different supramolecular polymers. Measured spectra are then compared to a library of measured standards. And the final evaluation is done by statistical methods.

Druh

G_funk - Funkční vzorek

CEP obor

—

OECD FORD obor

10600 - Biological sciences

Projekt

<a href="/cs/project/QJ1610515" target="_blank" >QJ1610515: Vliv výživy na epigenetický profil u českého strakatého skotu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

QJ1610515V003

Číselná identifikace

QJ1610515V003

Technické parametry

Výsledky byly ověřeny v rámci projektu QJ1610515. Funkční vzorek molekulárního senzoru byl testován na reálných vzorcích roztoků a standardizovaných vzorcích. Získané výsledky potvrdili inovaci, funkčnost a využitelnost funkčního vzorku pro běžnou praxi. Licenční smlouva nebyla dosud uzavřena. Sensor na bázi supramolekulárního polymeru dle výše uvedeného technického řešení koncipovaný pro orientační stanovení epigenetických markerů bude sloužit jako rychlý screeningový nástroj pro epigenetické profilování ve vodných fyziologických roztocích pro skot. Podstata technického řešení molekulárního senzoru pro orientační stanovení epigenetických markerů na bází supramolekulárních polymerů ve vodných fyziologických systémech spočívá na kvantitativním spektroskopickém stanovení UV/Vis či fluorescence. Principem je interakce methylovaných oligonukleotidů DNA s chelátorem na bázi derivátu sacharinu za vzniku supramolekulárniho polymeru v pufrovaném vodném roztoku s charakteristickou spektrální změnou. Funkční vzorek je zejména tvořen srovnávací sadou 5 fluorescenčních kyvet (o délce strany 1 cm z plastu). Do každé kyvety je přidán malý přídavek cca 25 uL koncentrovaného roztoku chelátoru, k němu je přikápnut 25 uL koncentrovaného roztoku příslušného kovového iontu ve vodě. Po promíchání obou roztoků, je přidán roztok obsahující vzorek a objem kyvety je doplněn na 2,4 ml. Daný vzorek je tedy analyticky srovnán pomocí pěti různých supramolekulárních polymerů. Naměřená spektra jsou následně porovnána s knihovnou naměřených standardů. Finální vyhodnocení je provedeno statistickými metodami. Sekvence DNA standardů (C zastupuje v jednotlivých standardech různě modifikovaný cytosin: nemodifikovaný, 5 methylovaný, 5-hydroxymethylovaný, 5-karboxymethylovaný či 5 formylmethylovaný): 5&apos;CGGGGTACCTTCACTTCAGAATCAACCAAACAGCCAAAACTGTTACATCAGGTTGTGGAGCAGTTACAAAAGGTTCATTTTATCACAGATACCCTGTCAAAGGGTGAGACAAAGTTCATGGGTGTTTGCCAGCTTCCCAGTAAAAATGATGAAAAAGAATATCCACACAGAAGAATTGATATCAGGTTGATACCCAAAGATCAGTATTACTGTGGTGTTCTCTATTTCACTGGGAGTGATATTTTCAATAAGAATATGAGGGCTCATGCCCTAGAAAAGGGTTTCACAATCAATGAGTACACCATCCGTCCCTTGGGAGTCACTGGAGTTGCAGGAGAACCCCTGCCAGTGGATAGTGAAAAAGACATCTTTGATTACATCCAGTGGAAATACCGGGAACCCAAGGACCGGAGCGAAGAATTCCCG3&apos;.

Ekonomické parametry

Jelikož se jedná o aplikaci a potvrzení klasických analytických technik molekulární spektroskopie, jeví se jako nejvýraznější přínos úspora nákladů pro analýzu. Taktéž existují i jiné přínosy jako jsou úspora času z hlediska rychlosti detekce analyzovaných molekulárních systémů. Jedná se o screeningovou techniku, která obecně přináší úsporu času a nákladů. Výhoda technického řešení je zejména v jeho jednoduchosti a nízké ceně oproti komerčním technicky náročným bioanalytickým technikám. Využitelnost bude realizována zejména v zemědělských družstvech, tam kde je nutné orientačně, rychle a levně zjistit či porovnat výskyt epigenetických markerů ve fyziologických roztocích srovnáním s knihovnou.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

00216208

Název vlastníka

Univerzita Karlova, 1. lékařská fakulta

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

P - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence

Požadavek na licenční poplatek

Z - Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje v některých případech licenční poplatek

Adresa www stránky s výsledkem

—