Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Identification of susceptibility pathways for the role of chromosome 15q25.1 in modifying lung cancer risk

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F18%3A10378374" target="_blank" >RIV/00216208:11110/18:10378374 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1038/s41467-018-05074-y" target="_blank" >https://doi.org/10.1038/s41467-018-05074-y</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41467-018-05074-y" target="_blank" >10.1038/s41467-018-05074-y</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Identification of susceptibility pathways for the role of chromosome 15q25.1 in modifying lung cancer risk

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Genome-wide association studies (GWAS) identified the chromosome 15q25.1 locus as a leading susceptibility region for lung cancer. However, the pathogenic pathways, through which susceptibility SNPs within chromosome 15q25.1 affects lung cancer risk, have not been explored. We analyzed three cohorts with GWAS data consisting 42,901 individuals and lung expression quantitative trait loci (eQTL) data on 409 individuals to identify and validate the underlying pathways and to investigate the combined effect of genes from the identified susceptibility pathways. The KEGG neuroactive ligand receptor interaction pathway, two Reactome pathways, and 22 Gene Ontology terms were identified and replicated to be significantly associated with lung cancer risk, with P values less than 0.05 and FDR less than 0.1. Functional annotation of eQTL analysis results showed that the neuroactive ligand receptor interaction pathway and gated channel activity were involved in lung cancer risk. These pathways provide important insights for the etiology of lung cancer.

  • Název v anglickém jazyce

    Identification of susceptibility pathways for the role of chromosome 15q25.1 in modifying lung cancer risk

  • Popis výsledku anglicky

    Genome-wide association studies (GWAS) identified the chromosome 15q25.1 locus as a leading susceptibility region for lung cancer. However, the pathogenic pathways, through which susceptibility SNPs within chromosome 15q25.1 affects lung cancer risk, have not been explored. We analyzed three cohorts with GWAS data consisting 42,901 individuals and lung expression quantitative trait loci (eQTL) data on 409 individuals to identify and validate the underlying pathways and to investigate the combined effect of genes from the identified susceptibility pathways. The KEGG neuroactive ligand receptor interaction pathway, two Reactome pathways, and 22 Gene Ontology terms were identified and replicated to be significantly associated with lung cancer risk, with P values less than 0.05 and FDR less than 0.1. Functional annotation of eQTL analysis results showed that the neuroactive ligand receptor interaction pathway and gated channel activity were involved in lung cancer risk. These pathways provide important insights for the etiology of lung cancer.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30304 - Public and environmental health

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nature Communications [online]

  • ISSN

    2041-1723

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    August

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    15

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000441381200005

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85051632965