Caution: Plasmid DNA topology affects luciferase assay reproducibility and outcomes
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F19%3A10400401" target="_blank" >RIV/00216208:11110/19:10400401 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=Z68x6MgBOT" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=Z68x6MgBOT</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.2144/btn-2019-0060" target="_blank" >10.2144/btn-2019-0060</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Caution: Plasmid DNA topology affects luciferase assay reproducibility and outcomes
Popis výsledku v původním jazyce
In summary, we have identified another factor that can affect the outcome of luciferase reporter assays of sequence variants mapping to gene regulatory regions. We recommend routine assessment of plasmid topology and the use of only plasmids that are supercoiled for transfection. Good laboratory practice would further suggest that all reporter plasmids to be assayed are prepared simultaneously, that test and control plasmids are analyzed on the same plate, and that a minimum of three technical and three biological replicates are performed for each experiment.
Název v anglickém jazyce
Caution: Plasmid DNA topology affects luciferase assay reproducibility and outcomes
Popis výsledku anglicky
In summary, we have identified another factor that can affect the outcome of luciferase reporter assays of sequence variants mapping to gene regulatory regions. We recommend routine assessment of plasmid topology and the use of only plasmids that are supercoiled for transfection. Good laboratory practice would further suggest that all reporter plasmids to be assayed are prepared simultaneously, that test and control plasmids are analyzed on the same plate, and that a minimum of three technical and three biological replicates are performed for each experiment.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
30204 - Oncology
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/NV16-33444A" target="_blank" >NV16-33444A: Klinická klasifikace sekvenčních variant v nekódujících regulačních oblastech genů predisponujících ke vzniku karcinomu prsu</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
BioTechniques
ISSN
0736-6205
e-ISSN
—
Svazek periodika
67
Číslo periodika v rámci svazku
3
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
3
Strana od-do
94-96
Kód UT WoS článku
000482337700005
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85071372202