Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Life time of some RNA products of rDNA intergenic spacer in HeLa cells

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F19%3A10400915" target="_blank" >RIV/00216208:11110/19:10400915 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=hz0aasD9RR" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=hz0aasD9RR</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00418-019-01804-5" target="_blank" >10.1007/s00418-019-01804-5</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Life time of some RNA products of rDNA intergenic spacer in HeLa cells

  • Popis výsledku v původním jazyce

    In human cells, the intergenic spacers (IGS), which separate ribosomal genes, are complex approximately 30 kb-long loci. Recent studies indicate that all, or almost all, parts of IGS may be transcribed, and that at least some of them are involved in the regulation of the ribosomal DNA (rDNA) transcription, maintenance of the nucleolar architecture, and response of the cell nucleus to stress. However, since each cell contains hundreds not quite identical copies of IGS, the structure and functions of this locus remain poorly understood, and the dynamics of its products has not been specially studied. In this work, we used quantitative PCR to measure the expression levels of various rDNA regions at different times after inhibition of the transcription by Actinomycin D applied in high doses. This approach allowed us to measure real or extrapolated half-life times of some IGS loci. Our study reveals characteristic dynamic patterns suggestive of various pathways of RNA utilization and decay.

  • Název v anglickém jazyce

    Life time of some RNA products of rDNA intergenic spacer in HeLa cells

  • Popis výsledku anglicky

    In human cells, the intergenic spacers (IGS), which separate ribosomal genes, are complex approximately 30 kb-long loci. Recent studies indicate that all, or almost all, parts of IGS may be transcribed, and that at least some of them are involved in the regulation of the ribosomal DNA (rDNA) transcription, maintenance of the nucleolar architecture, and response of the cell nucleus to stress. However, since each cell contains hundreds not quite identical copies of IGS, the structure and functions of this locus remain poorly understood, and the dynamics of its products has not been specially studied. In this work, we used quantitative PCR to measure the expression levels of various rDNA regions at different times after inhibition of the transcription by Actinomycin D applied in high doses. This approach allowed us to measure real or extrapolated half-life times of some IGS loci. Our study reveals characteristic dynamic patterns suggestive of various pathways of RNA utilization and decay.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10601 - Cell biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Histochemistry and Cell Biology

  • ISSN

    0948-6143

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    152

  • Číslo periodika v rámci svazku

    4

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    271-280

  • Kód UT WoS článku

    000490007500003

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85069724376