Po stopách genetických příčin chronického onemocnění ledvin

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F21%3A10436404" target="_blank" >RIV/00216208:11110/21:10436404 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=hhPE-b0IN~" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=hhPE-b0IN~</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Po stopách genetických příčin chronického onemocnění ledvin

Popis výsledku v původním jazyce

Chronické onemocnění ledvin (CKD) je komplexní, klinicky heterogenní onemocnění postihující ~10 % populace. Na jeho vzniku a průběhu se podílí kombinace genetických faktorů a vlivů vnějšího prostředí. Genetické faktory přispívají ke vzniku CKD ze 40-75 %. Jednotlivé složky genetické komponenty, tj. geny a jejich varianty, jsou postupně nalézány v rodinách s monogenními (mendelovskými) formami CKD a metodami celogenomových asociačních studií v populačních kohortách pacientů s CKD. Následně je studován příspěvek vzácných i populačně častých genetických variant v těchto genech k rozvoji a průběhu nemoci, jak u pacientů s monogenními formami CKD, tak i v běžné populaci. V současnosti je známo ~650 monogenních forem CKD. Jsou zodpovědné za ~70 % pediatrických a ~20 % dospělých případů. Jejich zastoupení je s výjimkou mutací v genech PKD1, PKD2, COL4A3-5, UMOD a MUC1 v populacích pacientů heterogenní a jednotlivě vzácné. Kritickým předpokladem úspěšné diagnostiky a výzkumu je motivace, aktivní přístup a spolupráce lékařů, pacientů a specializovaných laboratoří. Základním nástrojem diagnostiky CKD je exomové sekvenování. To v závislosti na způsobu klinického výběru pacientů umožňuje určit genetickou příčinu v ~30 % studovaných případů. U nevyřešených případů s podezřením na geneticky podmíněné CKD se zaměřujeme na lepší genetickou a funkční analýzu nalezených variant, případně jejich kombinací. Přistupujeme k sekvenaci celého genomu a analýze nekódujících mutací. Zvláštní kapitolu představuje analýza repetitivních a homologních oblastí lidského genomu a interpretace jejich variability. Pro ustanovení kauzality většiny takto určených genetických změn musíme provést cílenou analýzu tělních tekutin a tkání pacientů, případně vhodných buněčných a zvířecích modelů připravených metodami buněčného reprogramování nebo cílených změn genomu.

Název v anglickém jazyce

Finding the genetic causes of chronic kidney disease

Popis výsledku anglicky

Chronic kidney disease (CKD) is complex, clinically heterogeneous disease affecting ~10% population. Origin and course of CKD is determined by genetic and environmental factors. Genetic factors account for 40-75%. Genetic component, genes and their variants, have been increasingly identified, either in families with monogenic forms of CKD or in genome-wide association studies in CKD cohorts. Subsequently, the contribution of rare and common genetic variants in these genes to kidney disease is studied in patients with monogenic CKD and in the general population. At present, ~650 monogenic forms of CKD are known. They are responsible for ~70% of paediatric and ~20% of adult cases. With exception of mutations in PKD1, PKD2, COL4A3-5, UMOD and MUC1 genes, their representation in patient populations is heterogeneous and individually rare. Successful diagnostics and research depends on the motivation, active approach and cooperation of physicians, patients and specialized laboratories. Exome sequencing is basic tool for CKD diagnostics. Depending on the clinical selection it may identify the genetic cause in TILDE ~30% of the cases. In unsolved cases we focus on better genetic and functional characterization of identified variants. We perform whole-genome sequencing and analyse non-coding mutations. A special task presents the analysis of repetitive and homologous regions of the human genome and interpretation of their variability. To determine the causality of most of these variants, we must perform a targeted analysis of body fluids and tissues of patients, or suitable cell and animal models prepared by methods of cell reprogramming or targeted changes in the genome.

Druh

J_ost - Ostatní články v recenzovaných periodicích

CEP obor

—

OECD FORD obor

30101 - Human genetics

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Aktuality v nefrologii

ISSN

1210-955X

e-ISSN

—

Svazek periodika

27

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

15-26

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—