Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Sequencing-based analysis of clonal evolution of 25 mantle cell lymphoma patients at diagnosis and after failure of standard immunochemotherapy

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F23%3A10466776" target="_blank" >RIV/00216208:11110/23:10466776 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11130/23:10466776 RIV/00064203:_____/23:10466776 RIV/00064165:_____/23:10466776

  • Výsledek na webu

    <a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=TdMfY2a4B3" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=TdMfY2a4B3</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/ajh.27044" target="_blank" >10.1002/ajh.27044</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Sequencing-based analysis of clonal evolution of 25 mantle cell lymphoma patients at diagnosis and after failure of standard immunochemotherapy

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Our knowledge of genetic aberrations, that is, variants and copy number variations (CNVs), associated with mantle cell lymphoma (MCL) relapse remains limited. A cohort of 25 patients with MCL at diagnosis and the first relapse after the failure of standard immunochemotherapy was analyzed using whole-exome sequencing. The most frequent variants at diagnosis and at relapse comprised six genes: TP53, ATM, KMT2D, CCND1, SP140, and LRP1B. The most frequent CNVs at diagnosis and at relapse included TP53 and CDKN2A/B deletions, and PIK3CA amplifications. The mean count of mutations per patient significantly increased at relapse (n = 34) compared to diagnosis (n = 27). The most frequent newly detected variants at relapse, LRP1B gene mutations, correlated with a higher mutational burden. Variant allele frequencies of TP53 variants increased from 0.35 to 0.76 at relapse. The frequency and length of predicted CNVs significantly increased at relapse with CDKN2A/B deletions being the most frequent. Our data suggest, that the resistant MCL clones detected at relapse were already present at diagnosis and were selected by therapy. We observed enrichment of genetic aberrations of DNA damage response pathway (TP53 and CDKN2A/B), and a significant increase in MCL heterogeneity. We identified LRP1B inactivation as a new potential driver of MCL relapse.

  • Název v anglickém jazyce

    Sequencing-based analysis of clonal evolution of 25 mantle cell lymphoma patients at diagnosis and after failure of standard immunochemotherapy

  • Popis výsledku anglicky

    Our knowledge of genetic aberrations, that is, variants and copy number variations (CNVs), associated with mantle cell lymphoma (MCL) relapse remains limited. A cohort of 25 patients with MCL at diagnosis and the first relapse after the failure of standard immunochemotherapy was analyzed using whole-exome sequencing. The most frequent variants at diagnosis and at relapse comprised six genes: TP53, ATM, KMT2D, CCND1, SP140, and LRP1B. The most frequent CNVs at diagnosis and at relapse included TP53 and CDKN2A/B deletions, and PIK3CA amplifications. The mean count of mutations per patient significantly increased at relapse (n = 34) compared to diagnosis (n = 27). The most frequent newly detected variants at relapse, LRP1B gene mutations, correlated with a higher mutational burden. Variant allele frequencies of TP53 variants increased from 0.35 to 0.76 at relapse. The frequency and length of predicted CNVs significantly increased at relapse with CDKN2A/B deletions being the most frequent. Our data suggest, that the resistant MCL clones detected at relapse were already present at diagnosis and were selected by therapy. We observed enrichment of genetic aberrations of DNA damage response pathway (TP53 and CDKN2A/B), and a significant increase in MCL heterogeneity. We identified LRP1B inactivation as a new potential driver of MCL relapse.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30205 - Hematology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    American Journal of Hematology

  • ISSN

    0361-8609

  • e-ISSN

    1096-8652

  • Svazek periodika

    98

  • Číslo periodika v rámci svazku

    10

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    1627-1636

  • Kód UT WoS článku

    001052377200001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85168604207