Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Fine mapping of MHC region in lung cancer highlights independent susceptibility loci by ethnicity

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11130%2F18%3A10380363" target="_blank" >RIV/00216208:11130/18:10380363 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61989592:15110/18:73589223

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1038/s41467-018-05890-2" target="_blank" >https://doi.org/10.1038/s41467-018-05890-2</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41467-018-05890-2" target="_blank" >10.1038/s41467-018-05890-2</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Fine mapping of MHC region in lung cancer highlights independent susceptibility loci by ethnicity

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Lung cancer has several genetic associations identified within the major histocompatibility complex (MHC); although the basis for these associations remains elusive. Here, we analyze MHC genetic variation among 26,044 lung cancer patients and 20,836 controls densely genotyped across the MHC, using the Illumina Illumina OncoArray or Illumina 660W SNP microarray. We impute sequence variation in classical HLA genes, fine-map MHC associations for lung cancer risk with major histologies and compare results between ethnicities. Independent and novel associations within HLA genes are identified in Europeans including amino acids in the HLA-B*0801 peptide binding groove and an independent HLA-DQB1*06 loci group. In Asians, associations are driven by two independent HLA allele sets that both increase risk in HLA-DQB1*0401 and HLA-DRB1*0701; the latter better represented by the amino acid Ala-104. These results implicate several HLA-tumor peptide interactions as the major MHC factor modulating lung cancer susceptibility.

  • Název v anglickém jazyce

    Fine mapping of MHC region in lung cancer highlights independent susceptibility loci by ethnicity

  • Popis výsledku anglicky

    Lung cancer has several genetic associations identified within the major histocompatibility complex (MHC); although the basis for these associations remains elusive. Here, we analyze MHC genetic variation among 26,044 lung cancer patients and 20,836 controls densely genotyped across the MHC, using the Illumina Illumina OncoArray or Illumina 660W SNP microarray. We impute sequence variation in classical HLA genes, fine-map MHC associations for lung cancer risk with major histologies and compare results between ethnicities. Independent and novel associations within HLA genes are identified in Europeans including amino acids in the HLA-B*0801 peptide binding groove and an independent HLA-DQB1*06 loci group. In Asians, associations are driven by two independent HLA allele sets that both increase risk in HLA-DQB1*0401 and HLA-DRB1*0701; the latter better represented by the amino acid Ala-104. These results implicate several HLA-tumor peptide interactions as the major MHC factor modulating lung cancer susceptibility.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30502 - Other medical science

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nature Communications [online]

  • ISSN

    2041-1723

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    September

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    12

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000445562800006

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85053845843