Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Whole-Exome Sequencing Identifies a Novel Germline Variant in PTK7 Gene in Familial Colorectal Cancer

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11140%2F22%3A10443254" target="_blank" >RIV/00216208:11140/22:10443254 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=lpElKR3IDI" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=lpElKR3IDI</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/ijms23031295" target="_blank" >10.3390/ijms23031295</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Whole-Exome Sequencing Identifies a Novel Germline Variant in PTK7 Gene in Familial Colorectal Cancer

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Colorectal cancer (CRC) is the third most frequently diagnosed malignancy worldwide. Only 5% of all CRC cases are due to germline mutations in known predisposition genes, and the remaining genetic burden still has to be discovered. In this study, we performed whole-exome sequencing on six members of a Polish family diagnosed with CRC and identified a novel germline variant in the protein tyrosine kinase 7 (inactive) gene (PTK7, ENST00000230419, V354M). Targeted screening of the variant in 1705 familial CRC cases and 1674 healthy elderly individuals identified the variant in an additional familial CRC case. Introduction of this variant in HT-29 cells resulted in increased cell proliferation, migration, and invasion; it also caused down-regulation of CREB, p21 and p53 mRNA and protein levels, and increased AKT phosphorylation. These changes indicated inhibition of apoptosis pathways and activation of AKT signaling. Our study confirmed the oncogenic function of PTK7 and supported its role in genetic predisposition of familial CRC.

  • Název v anglickém jazyce

    Whole-Exome Sequencing Identifies a Novel Germline Variant in PTK7 Gene in Familial Colorectal Cancer

  • Popis výsledku anglicky

    Colorectal cancer (CRC) is the third most frequently diagnosed malignancy worldwide. Only 5% of all CRC cases are due to germline mutations in known predisposition genes, and the remaining genetic burden still has to be discovered. In this study, we performed whole-exome sequencing on six members of a Polish family diagnosed with CRC and identified a novel germline variant in the protein tyrosine kinase 7 (inactive) gene (PTK7, ENST00000230419, V354M). Targeted screening of the variant in 1705 familial CRC cases and 1674 healthy elderly individuals identified the variant in an additional familial CRC case. Introduction of this variant in HT-29 cells resulted in increased cell proliferation, migration, and invasion; it also caused down-regulation of CREB, p21 and p53 mRNA and protein levels, and increased AKT phosphorylation. These changes indicated inhibition of apoptosis pathways and activation of AKT signaling. Our study confirmed the oncogenic function of PTK7 and supported its role in genetic predisposition of familial CRC.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30204 - Oncology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    R - Projekt Ramcoveho programu EK

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    International Journal of Molecular Sciences

  • ISSN

    1661-6596

  • e-ISSN

    1422-0067

  • Svazek periodika

    23

  • Číslo periodika v rámci svazku

    3

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    20

  • Strana od-do

    1295

  • Kód UT WoS článku

    000760238500001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85123385608