ALK alterations in salivary gland carcinomas
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11150%2F21%3A10432751" target="_blank" >RIV/00216208:11150/21:10432751 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00179906:_____/21:10432751
Výsledek na webu
<a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=5JhxSo4glW" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=5JhxSo4glW</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00428-020-02971-w" target="_blank" >10.1007/s00428-020-02971-w</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
ALK alterations in salivary gland carcinomas
Popis výsledku v původním jazyce
Salivary gland carcinomas represent a heterogeneous group of poorly characterized head and neck tumors. The purpose of this study was to evaluate ALK gene and protein aberrations in a large, well-characterized cohort of these tumors. A total of 182 salivary gland carcinomas were tested for anaplastic lymphoma kinase (ALK) positivity by immunohistochemistry (IHC) using the cut-off of 10% positive cells. ALK positive tumors were subjected to FISH analysis and followed by hybrid capture-based next generation sequencing (NGS). Of the 182 tumors, 8 were ALK positive by IHC. Further analysis using hybrid capture NGS analysis revealed a novel MYO18A (Exon1-40)-ALK (exon 20-29) gene fusion in one case of intraductal carcinoma. Additional genomic analyses resulted in the detection of inactivating mutations in BRAF and TP53, as well as amplifications of ERBB2 and ALK. ALK rearrangements are a rare entity in salivary gland carcinomas. We identified a potentially targetable novel ALK fusion in an intraductal carcinoma of minor salivary glands.
Název v anglickém jazyce
ALK alterations in salivary gland carcinomas
Popis výsledku anglicky
Salivary gland carcinomas represent a heterogeneous group of poorly characterized head and neck tumors. The purpose of this study was to evaluate ALK gene and protein aberrations in a large, well-characterized cohort of these tumors. A total of 182 salivary gland carcinomas were tested for anaplastic lymphoma kinase (ALK) positivity by immunohistochemistry (IHC) using the cut-off of 10% positive cells. ALK positive tumors were subjected to FISH analysis and followed by hybrid capture-based next generation sequencing (NGS). Of the 182 tumors, 8 were ALK positive by IHC. Further analysis using hybrid capture NGS analysis revealed a novel MYO18A (Exon1-40)-ALK (exon 20-29) gene fusion in one case of intraductal carcinoma. Additional genomic analyses resulted in the detection of inactivating mutations in BRAF and TP53, as well as amplifications of ERBB2 and ALK. ALK rearrangements are a rare entity in salivary gland carcinomas. We identified a potentially targetable novel ALK fusion in an intraductal carcinoma of minor salivary glands.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
30109 - Pathology
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2021
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Virchows Archiv
ISSN
0945-6317
e-ISSN
—
Svazek periodika
478
Číslo periodika v rámci svazku
5
Stát vydavatele periodika
DE - Spolková republika Německo
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
933-941
Kód UT WoS článku
000592618300001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85096571792