Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

The Selection and Validation of Reference Genes for mRNA and microRNA Expression Studies in Human Liver Slices Using RT-qPCR

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11160%2F19%3A10398468" target="_blank" >RIV/00216208:11160/19:10398468 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11120/19:43918867 RIV/00179906:_____/19:10398468

  • Výsledek na webu

    <a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=v69s8JU7Nf" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=v69s8JU7Nf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/genes10100763" target="_blank" >10.3390/genes10100763</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    The Selection and Validation of Reference Genes for mRNA and microRNA Expression Studies in Human Liver Slices Using RT-qPCR

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The selection of a suitable combination of reference genes (RGs) for data normalization is a crucial step for obtaining reliable and reproducible results from transcriptional response analysis using a reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction. This is especially so if a three-dimensional multicellular model prepared from liver tissues originating from biologically diverse human individuals is used. The mRNA and miRNA RGs stability were studied in thirty-five human liver tissue samples and twelve precision-cut human liver slices (PCLS) treated for 24 h with dimethyl sulfoxide (controls) and PCLS treated with beta-naphthoflavone (10 mu M) or rifampicin (10 mu M) as cytochrome P450 (CYP) inducers. Validation of RGs was performed by an expression analysis of CYP3A4 and CYP1A2 on rifampicin and beta-naphthoflavone induction, respectively. Regarding mRNA, the best combination of RGs for the controls was YWHAZ and B2M, while YWHAZ and ACTB were selected for the liver samples and treated PCLS. Stability of all candidate miRNA RGs was comparable or better than that of generally used short non-coding RNA U6. The best combination for the control PCLS was miR-16-5p and miR-152-3p, in contrast to the miR-16-5b and miR-23b-3p selected for the treated PCLS. Our results showed that the candidate RGs were rather stable, especially for miRNA in human PCLS.

  • Název v anglickém jazyce

    The Selection and Validation of Reference Genes for mRNA and microRNA Expression Studies in Human Liver Slices Using RT-qPCR

  • Popis výsledku anglicky

    The selection of a suitable combination of reference genes (RGs) for data normalization is a crucial step for obtaining reliable and reproducible results from transcriptional response analysis using a reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction. This is especially so if a three-dimensional multicellular model prepared from liver tissues originating from biologically diverse human individuals is used. The mRNA and miRNA RGs stability were studied in thirty-five human liver tissue samples and twelve precision-cut human liver slices (PCLS) treated for 24 h with dimethyl sulfoxide (controls) and PCLS treated with beta-naphthoflavone (10 mu M) or rifampicin (10 mu M) as cytochrome P450 (CYP) inducers. Validation of RGs was performed by an expression analysis of CYP3A4 and CYP1A2 on rifampicin and beta-naphthoflavone induction, respectively. Regarding mRNA, the best combination of RGs for the controls was YWHAZ and B2M, while YWHAZ and ACTB were selected for the liver samples and treated PCLS. Stability of all candidate miRNA RGs was comparable or better than that of generally used short non-coding RNA U6. The best combination for the control PCLS was miR-16-5p and miR-152-3p, in contrast to the miR-16-5b and miR-23b-3p selected for the treated PCLS. Our results showed that the candidate RGs were rather stable, especially for miRNA in human PCLS.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30104 - Pharmacology and pharmacy

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Genes

  • ISSN

    2073-4425

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    10

  • Číslo periodika v rámci svazku

    10

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    17

  • Strana od-do

    763

  • Kód UT WoS článku

    000498397100034

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85072771584