The Minimal Proteome in the Reduced Mitochondrion of the Parasitic Protist Giardia intestinalis
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F11%3A10082564" target="_blank" >RIV/00216208:11310/11:10082564 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0017285" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0017285</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0017285" target="_blank" >10.1371/journal.pone.0017285</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
The Minimal Proteome in the Reduced Mitochondrion of the Parasitic Protist Giardia intestinalis
Popis výsledku v původním jazyce
The mitosomes of Giardia intestinalis are thought to be mitochondria highly-reduced in response to the oxygen-poor niche. We performed a quantitative proteomic assessment of Giardia mitosomes to increase understanding of the function and evolutionary origin of these enigmatic organelles. Mitosome-enriched fractions were obtained from cell homogenate using Optiprep gradient centrifugation. To distinguish mitosomal proteins from contamination, we used a quantitative shot-gun strategy based on isobaric tagging of peptides with iTRAQ and tandem mass spectrometry. Altogether, 638 proteins were identified in mitosome-enriched fractions. Of these, 139 proteins had iTRAQ ratio similar to that of the six known mitosomal markers. Proteins were selected for expression in Giardia to verify their cellular localizations and the mitosomal localization of 20 proteins was confirmed.
Název v anglickém jazyce
The Minimal Proteome in the Reduced Mitochondrion of the Parasitic Protist Giardia intestinalis
Popis výsledku anglicky
The mitosomes of Giardia intestinalis are thought to be mitochondria highly-reduced in response to the oxygen-poor niche. We performed a quantitative proteomic assessment of Giardia mitosomes to increase understanding of the function and evolutionary origin of these enigmatic organelles. Mitosome-enriched fractions were obtained from cell homogenate using Optiprep gradient centrifugation. To distinguish mitosomal proteins from contamination, we used a quantitative shot-gun strategy based on isobaric tagging of peptides with iTRAQ and tandem mass spectrometry. Altogether, 638 proteins were identified in mitosome-enriched fractions. Of these, 139 proteins had iTRAQ ratio similar to that of the six known mitosomal markers. Proteins were selected for expression in Giardia to verify their cellular localizations and the mitosomal localization of 20 proteins was confirmed.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
PLoS ONE
ISSN
1932-6203
e-ISSN
—
Svazek periodika
6
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
17
Strana od-do
"e17285", 1-17
Kód UT WoS článku
000287761700043
EID výsledku v databázi Scopus
—