Identification of 37 microsatellite loci for Anthophora plumipes (Hymenoptera: Apidae) using next generation sequencing and their utility in related species
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F12%3A10128487" target="_blank" >RIV/00216208:11310/12:10128487 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Identification of 37 microsatellite loci for Anthophora plumipes (Hymenoptera: Apidae) using next generation sequencing and their utility in related species
Popis výsledku v původním jazyce
Novel microsatellite markers for the solitary bee, Anthophora plumipes, were identified and characterised using 454 GS-FLX Titanium pyrosequencing technology. Thirty seven loci were tested using fluorescently labelled primers on a sample of 20 females from Prague. The number of alleles ranged from 1 to 10 (with a mean of 4 alleles per locus), resulting in an observed heterozygosity ranging from 0.05 to 0.9 and an expected heterozygosity from 0.097 to 0.887. None of the loci showed a significant deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium and only two loci showed the significant presence of null alleles. No linkage between loci was detected. We further provide information on a single multiplex PCR consisting of 11 of the most polymorphic loci. This multiplex approach provides an effective analytical tool for analysing genetic structure and carrying out parental analyses on Anthophora populations. Most of the 37 loci tested also showed robust amplification in five other Anthophora spec
Název v anglickém jazyce
Identification of 37 microsatellite loci for Anthophora plumipes (Hymenoptera: Apidae) using next generation sequencing and their utility in related species
Popis výsledku anglicky
Novel microsatellite markers for the solitary bee, Anthophora plumipes, were identified and characterised using 454 GS-FLX Titanium pyrosequencing technology. Thirty seven loci were tested using fluorescently labelled primers on a sample of 20 females from Prague. The number of alleles ranged from 1 to 10 (with a mean of 4 alleles per locus), resulting in an observed heterozygosity ranging from 0.05 to 0.9 and an expected heterozygosity from 0.097 to 0.887. None of the loci showed a significant deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium and only two loci showed the significant presence of null alleles. No linkage between loci was detected. We further provide information on a single multiplex PCR consisting of 11 of the most polymorphic loci. This multiplex approach provides an effective analytical tool for analysing genetic structure and carrying out parental analyses on Anthophora populations. Most of the 37 loci tested also showed robust amplification in five other Anthophora spec
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EG - Zoologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GAP506%2F10%2F0403" target="_blank" >GAP506/10/0403: Sousedské společenství: parazitické a sociální interakce u samotářských včel (Hymenoptera: Apoidea), hnízdní chování druhu Anthophora plumipes</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
European Journal of Entomology
ISSN
1210-5759
e-ISSN
—
Svazek periodika
109
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
6
Strana od-do
155-160
Kód UT WoS článku
000302587400003
EID výsledku v databázi Scopus
—