Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Towards a better understanding of the specificity of protein-protein interaction

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F12%3A10133499" target="_blank" >RIV/00216208:11310/12:10133499 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/86652036:_____/12:00385763 RIV/61388963:_____/12:00385763

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/jmr.2219" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1002/jmr.2219</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/jmr.2219" target="_blank" >10.1002/jmr.2219</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Towards a better understanding of the specificity of protein-protein interaction

  • Popis výsledku v původním jazyce

    In order to predict interaction interface for proteins, it is crucial to identify their characteristic features controlling the interaction process. We present analysis of 69 crystal structures of dimer protein complexes that provides a basis for reasonable description of the phenomenon. Interaction interfaces of two proteins at amino acids level were localized and described in terms of their chemical composition, binding preferences, and residue interaction energies utilizing Amber empirical force field. The characteristic properties of the interaction interface were compared against set of corresponding intramolecular binding parameters for amino acids in proteins. It has been found that geometrically distinct clusters of large hydrophobic amino acids (leucine, valine, isoleucine, and phenylalanine) as well as polar tyrosines and charged arginines are signatures of the proteinprotein interaction interface. At some extent, we can generalize that proteinprotein interaction (seen throug

  • Název v anglickém jazyce

    Towards a better understanding of the specificity of protein-protein interaction

  • Popis výsledku anglicky

    In order to predict interaction interface for proteins, it is crucial to identify their characteristic features controlling the interaction process. We present analysis of 69 crystal structures of dimer protein complexes that provides a basis for reasonable description of the phenomenon. Interaction interfaces of two proteins at amino acids level were localized and described in terms of their chemical composition, binding preferences, and residue interaction energies utilizing Amber empirical force field. The characteristic properties of the interaction interface were compared against set of corresponding intramolecular binding parameters for amino acids in proteins. It has been found that geometrically distinct clusters of large hydrophobic amino acids (leucine, valine, isoleucine, and phenylalanine) as well as polar tyrosines and charged arginines are signatures of the proteinprotein interaction interface. At some extent, we can generalize that proteinprotein interaction (seen throug

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    BO - Biofyzika

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2012

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Molecular Recognition

  • ISSN

    0952-3499

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    25

  • Číslo periodika v rámci svazku

    11

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    12

  • Strana od-do

    604-615

  • Kód UT WoS článku

    000310555100011

  • EID výsledku v databázi Scopus