Identification of a second Nutlin-3 responsive interaction site in the N-terminal domain of MDM2 using hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F13%3A10191637" target="_blank" >RIV/00216208:11310/13:10191637 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61388971:_____/13:00420952 RIV/00209805:_____/13:#0000414
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1002/pmic.201300029" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1002/pmic.201300029</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1002/pmic.201300029" target="_blank" >10.1002/pmic.201300029</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Identification of a second Nutlin-3 responsive interaction site in the N-terminal domain of MDM2 using hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry
Popis výsledku v původním jazyce
MDM2 is a multidomain protein that functions as an E3 ubiquitin ligase, transcription repressor, mRNA-binding protein, translation factor, and molecular chaperone. The small molecule Nutlin-3 has been engineered to bind to the N-terminal hydrophobic pocket domain of MDM2. This binding of Nutlin-3 has two consequences: (i) antagonistic effects through competitive disruption of the MDM2-p53 complex and (ii) agonist effects that allosterically stabilize MDM2 protein-protein interactions that increase p53 ubiquitination as well as nucleophosmin deoligomerization. We present a methodology using a hydrogen/deuterium (H/D) exchange platform that measures Nutlin-3 binding to the N-terminal domain of MDM2 (MDM2(1-126)) in order to begin to develop dynamic assays that evaluate MDM2 allostery. In order to localize the regions in MDM2 being suppressed by Nutlin-3, MDM2 was incubated with the ligand and H/D amide exchange was measured after pepsin digestion. One dynamic segment containing amino aci
Název v anglickém jazyce
Identification of a second Nutlin-3 responsive interaction site in the N-terminal domain of MDM2 using hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry
Popis výsledku anglicky
MDM2 is a multidomain protein that functions as an E3 ubiquitin ligase, transcription repressor, mRNA-binding protein, translation factor, and molecular chaperone. The small molecule Nutlin-3 has been engineered to bind to the N-terminal hydrophobic pocket domain of MDM2. This binding of Nutlin-3 has two consequences: (i) antagonistic effects through competitive disruption of the MDM2-p53 complex and (ii) agonist effects that allosterically stabilize MDM2 protein-protein interactions that increase p53 ubiquitination as well as nucleophosmin deoligomerization. We present a methodology using a hydrogen/deuterium (H/D) exchange platform that measures Nutlin-3 binding to the N-terminal domain of MDM2 (MDM2(1-126)) in order to begin to develop dynamic assays that evaluate MDM2 allostery. In order to localize the regions in MDM2 being suppressed by Nutlin-3, MDM2 was incubated with the ligand and H/D amide exchange was measured after pepsin digestion. One dynamic segment containing amino aci
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Proteomics
ISSN
1615-9853
e-ISSN
—
Svazek periodika
13
Číslo periodika v rámci svazku
16
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
14
Strana od-do
2512-2525
Kód UT WoS článku
000327008700014
EID výsledku v databázi Scopus
—