A systematic method for analysing the protein hydration structure of T4 lysozyme
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F13%3A10191799" target="_blank" >RIV/00216208:11310/13:10191799 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61388963:_____/13:00396329
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1002/jmr.2290" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1002/jmr.2290</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1002/jmr.2290" target="_blank" >10.1002/jmr.2290</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
A systematic method for analysing the protein hydration structure of T4 lysozyme
Popis výsledku v původním jazyce
A systematic method for the analysis of the hydration structure of proteins is demonstrated on the case study of lysozyme. The method utilises multiple structural data of the same protein deposited in the protein data bank. Clusters of high water occupancy are localised and characterised in terms of their interaction with protein. It is shown that they constitute a network of interconnected hydrogen bonds anchored to the protein molecule. The high occupancy of the clusters does not directly correlate with water-protein interaction energy as was originally hypothesised. The highly occupied clusters rather correspond to the nodes of the hydration network that have the maximum number of hydrogen bonds including both the protein atoms and the surrounding water clusters.
Název v anglickém jazyce
A systematic method for analysing the protein hydration structure of T4 lysozyme
Popis výsledku anglicky
A systematic method for the analysis of the hydration structure of proteins is demonstrated on the case study of lysozyme. The method utilises multiple structural data of the same protein deposited in the protein data bank. Clusters of high water occupancy are localised and characterised in terms of their interaction with protein. It is shown that they constitute a network of interconnected hydrogen bonds anchored to the protein molecule. The high occupancy of the clusters does not directly correlate with water-protein interaction energy as was originally hypothesised. The highly occupied clusters rather correspond to the nodes of the hydration network that have the maximum number of hydrogen bonds including both the protein atoms and the surrounding water clusters.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Molecular Recognition
ISSN
0952-3499
e-ISSN
—
Svazek periodika
26
Číslo periodika v rámci svazku
10
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
479-487
Kód UT WoS článku
000323674900006
EID výsledku v databázi Scopus
—