Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Microsatellite markers for direct genotyping of the crayfish plague pathogen Aphanomyces astaci (Oomycetes) from infected host tissues

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F14%3A10281553" target="_blank" >RIV/00216208:11310/14:10281553 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.vetmic.2014.02.020" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.vetmic.2014.02.020</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.vetmic.2014.02.020" target="_blank" >10.1016/j.vetmic.2014.02.020</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Microsatellite markers for direct genotyping of the crayfish plague pathogen Aphanomyces astaci (Oomycetes) from infected host tissues

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Aphanomyces astaci is an invasive pathogenic oomycete responsible for the crayfish plague, a disease that has devastated European freshwater crayfish. So far, five genotype groups of this pathogen have been identified by applying random amplified polymorphic DNA analysis on axenic cultures. To allow genotyping of A. astaci in host tissue samples, we have developed co-dominant microsatellite markers for this pathogen, tested them on pure cultures of all genotype groups, and subsequently evaluated their use on tissues of (1) natural A. astaci carriers, i.e., North American crayfish species, and (2) A. astaci-infected indigenous European species from crayfish plague outbreaks. Out of over 200 potential loci containing simple sequence repeat (SSR) motifs identified by 454 pyrosequencing of SSR-enriched library, we tested 25 loci with highest number of repeats, and finally selected nine that allow unambiguous separation of all known RAPD-defined genotype groups of A. astaci from axenic cult

  • Název v anglickém jazyce

    Microsatellite markers for direct genotyping of the crayfish plague pathogen Aphanomyces astaci (Oomycetes) from infected host tissues

  • Popis výsledku anglicky

    Aphanomyces astaci is an invasive pathogenic oomycete responsible for the crayfish plague, a disease that has devastated European freshwater crayfish. So far, five genotype groups of this pathogen have been identified by applying random amplified polymorphic DNA analysis on axenic cultures. To allow genotyping of A. astaci in host tissue samples, we have developed co-dominant microsatellite markers for this pathogen, tested them on pure cultures of all genotype groups, and subsequently evaluated their use on tissues of (1) natural A. astaci carriers, i.e., North American crayfish species, and (2) A. astaci-infected indigenous European species from crayfish plague outbreaks. Out of over 200 potential loci containing simple sequence repeat (SSR) motifs identified by 454 pyrosequencing of SSR-enriched library, we tested 25 loci with highest number of repeats, and finally selected nine that allow unambiguous separation of all known RAPD-defined genotype groups of A. astaci from axenic cult

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EH - Ekologie – společenstva

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Veterinary Microbiology

  • ISSN

    0378-1135

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    170

  • Číslo periodika v rámci svazku

    3-4

  • Stát vydavatele periodika

    NL - Nizozemsko

  • Počet stran výsledku

    8

  • Strana od-do

    317-324

  • Kód UT WoS článku

    000335624600015

  • EID výsledku v databázi Scopus