Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Dissecting a Hidden Gene Duplication: The Arabidopsis thaliana SEC10 Locus

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F14%3A10281647" target="_blank" >RIV/00216208:11310/14:10281647 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61389030:_____/14:00429536 RIV/61988987:17310/14:A1501CH3

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0094077" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0094077</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0094077" target="_blank" >10.1371/journal.pone.0094077</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Dissecting a Hidden Gene Duplication: The Arabidopsis thaliana SEC10 Locus

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Repetitive sequences present a challenge for genome sequence assembly, and highly similar segmental duplications may disappear from assembled genome sequences. Having found a surprising lack of observable phenotypic deviations and non-Mendelian segregation in Arabidopsis thaliana mutants in SEC10, a gene encoding a core subunit of the exocyst tethering complex, we examined whether this could be explained by a hidden gene duplication. Re-sequencing and manual assembly of the Arabidopsis thaliana SEC10 (At5g12370) locus revealed that this locus, comprising a single gene in the reference genome assembly, indeed contains two paralogous genes in tandem, SEC10a and SEC10b, and that a sequence segment of 7 kb in length is missing from the reference genome sequence. Differences between the two paralogs are concentrated in non-coding regions, while the predicted protein sequences exhibit 99% identity, differing only by substitution of five amino acid residues and an indel of four residues. Both

  • Název v anglickém jazyce

    Dissecting a Hidden Gene Duplication: The Arabidopsis thaliana SEC10 Locus

  • Popis výsledku anglicky

    Repetitive sequences present a challenge for genome sequence assembly, and highly similar segmental duplications may disappear from assembled genome sequences. Having found a surprising lack of observable phenotypic deviations and non-Mendelian segregation in Arabidopsis thaliana mutants in SEC10, a gene encoding a core subunit of the exocyst tethering complex, we examined whether this could be explained by a hidden gene duplication. Re-sequencing and manual assembly of the Arabidopsis thaliana SEC10 (At5g12370) locus revealed that this locus, comprising a single gene in the reference genome assembly, indeed contains two paralogous genes in tandem, SEC10a and SEC10b, and that a sequence segment of 7 kb in length is missing from the reference genome sequence. Differences between the two paralogs are concentrated in non-coding regions, while the predicted protein sequences exhibit 99% identity, differing only by substitution of five amino acid residues and an indel of four residues. Both

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    PLoS ONE

  • ISSN

    1932-6203

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    4

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000336736200036

  • EID výsledku v databázi Scopus