Molecular diversity of green corticolous microalgae from two sub-Mediterranean European localities
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F14%3A10283715" target="_blank" >RIV/00216208:11310/14:10283715 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1080/09670262.2014.945190" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1080/09670262.2014.945190</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1080/09670262.2014.945190" target="_blank" >10.1080/09670262.2014.945190</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Molecular diversity of green corticolous microalgae from two sub-Mediterranean European localities
Popis výsledku v původním jazyce
Green algae in corticolous biofilms are simple coccoid cells or filamentous thalli with strikingly low morphological diversity. Consequently, microscopic identification of these organisms is difficult, and often possible only to higher taxonomic units. We investigated the taxonomic and phylogenetic composition of green microalgae isolated from biofilms growing on the bark of Quercus pubescens and Pinus nigra. The study was based on 122 partial sequences of the plastid-encoded rbcL gene. In total, 29 operational taxonomic units (OTUs), differing in their rbcL sequences, were encountered. Members of the Trebouxiophyceae formed 97.5% of the isolates; Streptophyta made up 2.5%. The most frequently occurring OTUs were in the genera Coccomyxa, Parachloroidium and Stichococcus. Within the Watanabea clade, we have probably discovered an as-yet undescribed generic lineage with chlorelloid morphology. OTUs belonging to the recently described trebouxiophycean genera Kalinella, Leptochlorella and
Název v anglickém jazyce
Molecular diversity of green corticolous microalgae from two sub-Mediterranean European localities
Popis výsledku anglicky
Green algae in corticolous biofilms are simple coccoid cells or filamentous thalli with strikingly low morphological diversity. Consequently, microscopic identification of these organisms is difficult, and often possible only to higher taxonomic units. We investigated the taxonomic and phylogenetic composition of green microalgae isolated from biofilms growing on the bark of Quercus pubescens and Pinus nigra. The study was based on 122 partial sequences of the plastid-encoded rbcL gene. In total, 29 operational taxonomic units (OTUs), differing in their rbcL sequences, were encountered. Members of the Trebouxiophyceae formed 97.5% of the isolates; Streptophyta made up 2.5%. The most frequently occurring OTUs were in the genera Coccomyxa, Parachloroidium and Stichococcus. Within the Watanabea clade, we have probably discovered an as-yet undescribed generic lineage with chlorelloid morphology. OTUs belonging to the recently described trebouxiophycean genera Kalinella, Leptochlorella and
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EF - Botanika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GAP506%2F12%2F0955" target="_blank" >GAP506/12/0955: Integrovaný výzkum taxonomie a diverzity subaerických epifytických zelených řas v mediteránních ekosystémech</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
European Journal of Phycology
ISSN
0967-0262
e-ISSN
—
Svazek periodika
49
Číslo periodika v rámci svazku
3
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
345-355
Kód UT WoS článku
000340995700007
EID výsledku v databázi Scopus
—