Fluorescence-Based High-Throughput Screening of Dicer Cleavage Activity
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F14%3A10285614" target="_blank" >RIV/00216208:11310/14:10285614 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68378050:_____/14:00434676
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1177/1087057113497400" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1177/1087057113497400</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1177/1087057113497400" target="_blank" >10.1177/1087057113497400</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Fluorescence-Based High-Throughput Screening of Dicer Cleavage Activity
Popis výsledku v původním jazyce
Production of small RNAs by ribonuclease III Dicer is a key step in microRNA and RNA interference pathways, which employ Dicer-produced small RNAs as sequence-specific silencing guides. Further studies and manipulations of microRNA and RNA interference pathways would benefit from identification of small-molecule modulators. Here, we report a study of a fluorescence-based in vitro Dicer cleavage assay, which was adapted for high-throughput screening. The kinetic assay can be performed under single-turnover conditions (35 nM substrate and 70 nM Dicer) in a small volume (5 mu L), which makes it suitable for high-throughput screening in a 1536-well format. As a proof of principle, a small library of bioactive compounds was analyzed, demonstrating potentialof the assay.
Název v anglickém jazyce
Fluorescence-Based High-Throughput Screening of Dicer Cleavage Activity
Popis výsledku anglicky
Production of small RNAs by ribonuclease III Dicer is a key step in microRNA and RNA interference pathways, which employ Dicer-produced small RNAs as sequence-specific silencing guides. Further studies and manipulations of microRNA and RNA interference pathways would benefit from identification of small-molecule modulators. Here, we report a study of a fluorescence-based in vitro Dicer cleavage assay, which was adapted for high-throughput screening. The kinetic assay can be performed under single-turnover conditions (35 nM substrate and 70 nM Dicer) in a small volume (5 mu L), which makes it suitable for high-throughput screening in a 1536-well format. As a proof of principle, a small library of bioactive compounds was analyzed, demonstrating potentialof the assay.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Biomolecular Screening
ISSN
1087-0571
e-ISSN
—
Svazek periodika
19
Číslo periodika v rámci svazku
3
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
10
Strana od-do
417-426
Kód UT WoS článku
000330756600009
EID výsledku v databázi Scopus
—