Microbial abundance in surface ice on the Greenland Ice Sheet

Kód výsledku v IS VaVaI

RIV/00216208:11310/15:10296075 - isvavai.cz

Nalezeny alternativní kódy

RIV/60076658:12310/15:43888908

Výsledek na webu

http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.00225

DOI - Digital Object Identifier

10.3389/fmicb.2015.00225

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Microbial abundance in surface ice on the Greenland Ice Sheet

Popis výsledku v původním jazyce

Measuring microbial abundance in glacier ice and identifying its controls is essential for a better understanding and quantification of biogeochemical processes in glacial ecosystems. However, cell enumeration of glacier ice samples is challenging due totypically low cell numbers and the presence of interfering mineral particles.We quantified for the first time the abundance of microbial cells in surface ice from geographically distinct sites on the Greenland Ice Sheet (GrIS), using three enumeration methods: epifluorescence microscopy (EFM), flow cytometry (FCM), and quantitative polymerase chain reaction (qPCR).In addition, we reviewed published data on microbial abundance in glacier ice and tested the three methods on artificial ice samples of realistic cell (10(2)-10(7) cells ml(-1)) and mineral particle (0.1-100 mg ml(-1)) concentrations, simulating a range of glacial ice types, from clean subsurface ice to surface ice to sediment-laden basal ice. We then used multivariate statis

Název v anglickém jazyce

Microbial abundance in surface ice on the Greenland Ice Sheet

Popis výsledku anglicky

Measuring microbial abundance in glacier ice and identifying its controls is essential for a better understanding and quantification of biogeochemical processes in glacial ecosystems. However, cell enumeration of glacier ice samples is challenging due totypically low cell numbers and the presence of interfering mineral particles.We quantified for the first time the abundance of microbial cells in surface ice from geographically distinct sites on the Greenland Ice Sheet (GrIS), using three enumeration methods: epifluorescence microscopy (EFM), flow cytometry (FCM), and quantitative polymerase chain reaction (qPCR).In addition, we reviewed published data on microbial abundance in glacier ice and tested the three methods on artificial ice samples of realistic cell (10(2)-10(7) cells ml(-1)) and mineral particle (0.1-100 mg ml(-1)) concentrations, simulating a range of glacial ice types, from clean subsurface ice to surface ice to sediment-laden basal ice. We then used multivariate statis

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

LM2010009: Projekt CzechPolar - České polární stanice: Stavba a operační náklady

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Frontiers in Microbiology

ISSN

1664-302X

e-ISSN

—

Svazek periodika

6

Číslo periodika v rámci svazku

MAR 24 2015

Stát vydavatele periodika

CH - Švýcarská konfederace

Počet stran výsledku

12

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

000352518100001

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-84927523235