Enzymological description of multitemplate PCR-Shrinking amplification bias by optimizing the polymerase-template ratio
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F15%3A10314751" target="_blank" >RIV/00216208:11310/15:10314751 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61388963:_____/15:00449810 RIV/70883521:28110/15:43873020
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2015.06.048" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2015.06.048</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2015.06.048" target="_blank" >10.1016/j.jtbi.2015.06.048</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Enzymological description of multitemplate PCR-Shrinking amplification bias by optimizing the polymerase-template ratio
Popis výsledku v původním jazyce
Multitemplate polymerase chain reaction (PCR) is used for preparative and analytical applications in diagnostics and research. Classical PCR and qPCR are two basic setups with many possible experimental modifications. Classical PCR is a method of choiceto obtain enough material for subsequent sophisticated applications such as construction of libraries for next-generation sequencing or high-throughput screening. Sequencing and Single Nucleotide Primer Extension (SNuPE) employ one-strand synthesis and represent a distinct variant of analytical DNA synthesis. In all these applications, maintaining the initial ratio of templates and avoiding underestimation of minority templates is desired. Here, we demonstrate that different templates can amplify independently at low template concentrations (typical in qPCR setups, in which the polymerase concentration is usually several orders of magnitude higher than the template concentration). However, rare templates can be diluted in an effort to k
Název v anglickém jazyce
Enzymological description of multitemplate PCR-Shrinking amplification bias by optimizing the polymerase-template ratio
Popis výsledku anglicky
Multitemplate polymerase chain reaction (PCR) is used for preparative and analytical applications in diagnostics and research. Classical PCR and qPCR are two basic setups with many possible experimental modifications. Classical PCR is a method of choiceto obtain enough material for subsequent sophisticated applications such as construction of libraries for next-generation sequencing or high-throughput screening. Sequencing and Single Nucleotide Primer Extension (SNuPE) employ one-strand synthesis and represent a distinct variant of analytical DNA synthesis. In all these applications, maintaining the initial ratio of templates and avoiding underestimation of minority templates is desired. Here, we demonstrate that different templates can amplify independently at low template concentrations (typical in qPCR setups, in which the polymerase concentration is usually several orders of magnitude higher than the template concentration). However, rare templates can be diluted in an effort to k
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Theoretical Biology
ISSN
0022-5193
e-ISSN
—
Svazek periodika
382
Číslo periodika v rámci svazku
7 October 2015
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
178-186
Kód UT WoS článku
000361085200017
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-84937848180