Polymerase Synthesis and Restriction Enzyme Cleavage of DNA Containing 7-Substituted 7-Deazaguanine Nucleobases

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F15%3A10315455" target="_blank" >RIV/00216208:11310/15:10315455 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/61388963:_____/15:00451292

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1002/cbic.201500315" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1002/cbic.201500315</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1002/cbic.201500315" target="_blank" >10.1002/cbic.201500315</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Polymerase Synthesis and Restriction Enzyme Cleavage of DNA Containing 7-Substituted 7-Deazaguanine Nucleobases

Popis výsledku v původním jazyce

Previous studies of polymerase synthesis of base-modified DNAs and their cleavage by restriction enzymes have mostly related only to 5-substituted pyrimidine and 7-substituted 7-deazaadenine nucleotides. Here we report the synthesis of a series of 7-substituted 7-deazaguanine 2'-deoxyribonucleoside 5'-O-triphosphates (dGRTPs), their use as substrates for polymerase synthesis of modified DNA and the influence of the modification on their cleavage by type II restriction endonucleases (REs). The dGRTPs were generally good substrates for polymerases but the PCR products could not be visualised on agarose gels by intercalator staining, due to fluorescence quenching. The presence of 7-substituted 7-deazaguanine residues in recognition sequences of REs in most cases completely blocked the cleavage.

Název v anglickém jazyce

Polymerase Synthesis and Restriction Enzyme Cleavage of DNA Containing 7-Substituted 7-Deazaguanine Nucleobases

Popis výsledku anglicky

Previous studies of polymerase synthesis of base-modified DNAs and their cleavage by restriction enzymes have mostly related only to 5-substituted pyrimidine and 7-substituted 7-deazaadenine nucleotides. Here we report the synthesis of a series of 7-substituted 7-deazaguanine 2'-deoxyribonucleoside 5'-O-triphosphates (dGRTPs), their use as substrates for polymerase synthesis of modified DNA and the influence of the modification on their cleavage by type II restriction endonucleases (REs). The dGRTPs were generally good substrates for polymerases but the PCR products could not be visualised on agarose gels by intercalator staining, due to fluorescence quenching. The presence of 7-substituted 7-deazaguanine residues in recognition sequences of REs in most cases completely blocked the cleavage.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CC - Organická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA14-04289S" target="_blank" >GA14-04289S: Modifikace a bioorthogonální reakce ve velkém žlábku DNA pro regulaci vazby proteinů a genové exprese</a><br>

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chembiochem : a European journal of chemical biology

ISSN

1439-4227

e-ISSN

—

Svazek periodika

16

Číslo periodika v rámci svazku

15

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

12

Strana od-do

2225-2236

Kód UT WoS článku

000363422000016

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-84943352901