Messenger RNAs of Yeast Virus-Like Elements Contain Non-templated 5 ' Poly(A) Leaders, and Their Expression Is Independent of eIF4E and Pab1
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F19%3A10405275" target="_blank" >RIV/00216208:11310/19:10405275 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=MvSEK.yDuY" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=MvSEK.yDuY</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2019.02366" target="_blank" >10.3389/fmicb.2019.02366</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Messenger RNAs of Yeast Virus-Like Elements Contain Non-templated 5 ' Poly(A) Leaders, and Their Expression Is Independent of eIF4E and Pab1
Popis výsledku v původním jazyce
We employed virus-like elements (VLEs) pGKL1,2 from Kluyveromyces lactis as a model to investigate the previously neglected transcriptome of the broader group of yeast cytoplasmic linear dsDNA VLEs. We performed 5' and 3' RACE analyses of all pGKL1,2 mRNAs and found them not 3' polyadenylated and containing frequently uncapped 5' poly(A) leaders that are not complementary to VLE genomic DNA. The degree of 5' capping and/or 5' mRNA polyadenylation is specific to each gene and is controlled by the corresponding promoter region. The expression of pGKL1,2 transcripts is independent of eIF4E and Pab1 and is enhanced in lsm1 Delta and pab1 Delta strains. We suggest a model of primitive pGKL1,2 gene expression regulation in which the degree of 5' mRNA capping and 5' non-template polyadenylation, together with the presence of negative regulators such as Pab1 and Lsm1, play important roles. Our data also support a hypothesis of a close relationship between yeast linear VLEs and poxviruses.
Název v anglickém jazyce
Messenger RNAs of Yeast Virus-Like Elements Contain Non-templated 5 ' Poly(A) Leaders, and Their Expression Is Independent of eIF4E and Pab1
Popis výsledku anglicky
We employed virus-like elements (VLEs) pGKL1,2 from Kluyveromyces lactis as a model to investigate the previously neglected transcriptome of the broader group of yeast cytoplasmic linear dsDNA VLEs. We performed 5' and 3' RACE analyses of all pGKL1,2 mRNAs and found them not 3' polyadenylated and containing frequently uncapped 5' poly(A) leaders that are not complementary to VLE genomic DNA. The degree of 5' capping and/or 5' mRNA polyadenylation is specific to each gene and is controlled by the corresponding promoter region. The expression of pGKL1,2 transcripts is independent of eIF4E and Pab1 and is enhanced in lsm1 Delta and pab1 Delta strains. We suggest a model of primitive pGKL1,2 gene expression regulation in which the degree of 5' mRNA capping and 5' non-template polyadenylation, together with the presence of negative regulators such as Pab1 and Lsm1, play important roles. Our data also support a hypothesis of a close relationship between yeast linear VLEs and poxviruses.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10606 - Microbiology
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Frontiers in Microbiology
ISSN
1664-302X
e-ISSN
—
Svazek periodika
10
Číslo periodika v rámci svazku
October
Stát vydavatele periodika
CH - Švýcarská konfederace
Počet stran výsledku
26
Strana od-do
2366
Kód UT WoS článku
000497500500001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85074598602