Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Population Genomic Analysis of Diploid-Autopolyploid Species

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F23%3A10477453" target="_blank" >RIV/00216208:11310/23:10477453 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1007/978-1-0716-2561-3_16" target="_blank" >https://doi.org/10.1007/978-1-0716-2561-3_16</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-2561-3_16" target="_blank" >10.1007/978-1-0716-2561-3_16</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Population Genomic Analysis of Diploid-Autopolyploid Species

  • Popis výsledku v původním jazyce

    This chapter outlines an empirical analysis of genome-wide single-nucleotide polymorphism (SNP) variation and its underlying drivers among multiple natural populations within a diploid-autopolyploid species.The aim is to reconstruct the genetic structure among natural populations of varying ploidy and infer footprints of selection in these populations, framed around specific questions that are typically encountered when analyzing a mixed-ploidy data set,e.g., addressing the relevance of natural whole-genome duplication for speciation and adaptation. We briefly review the options for the analysis of polyploid population genomic data involving variant calling, population structure, demographic history inference, and selection scanning approaches. Further, we provide suggestions for methods and associated software, possible caveats, and examples of their application to mixed-ploidy and autopolyploid data sets.

  • Název v anglickém jazyce

    Population Genomic Analysis of Diploid-Autopolyploid Species

  • Popis výsledku anglicky

    This chapter outlines an empirical analysis of genome-wide single-nucleotide polymorphism (SNP) variation and its underlying drivers among multiple natural populations within a diploid-autopolyploid species.The aim is to reconstruct the genetic structure among natural populations of varying ploidy and infer footprints of selection in these populations, framed around specific questions that are typically encountered when analyzing a mixed-ploidy data set,e.g., addressing the relevance of natural whole-genome duplication for speciation and adaptation. We briefly review the options for the analysis of polyploid population genomic data involving variant calling, population structure, demographic history inference, and selection scanning approaches. Further, we provide suggestions for methods and associated software, possible caveats, and examples of their application to mixed-ploidy and autopolyploid data sets.

Klasifikace

  • Druh

    C - Kapitola v odborné knize

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10611 - Plant sciences, botany

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA20-22783S" target="_blank" >GA20-22783S: Genomová duplikace jako nedokonalá speciační bariéra? Evoluční mechanismy a důsledky mezi-ploidní introgrese v přírodních populacích</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název knihy nebo sborníku

    Polyploidy: Methods and Protocols

  • ISBN

    978-1-07-162560-6

  • Počet stran výsledku

    28

  • Strana od-do

    297-324

  • Počet stran knihy

    515

  • Název nakladatele

    Humana, New York, NY

  • Místo vydání

    New York

  • Kód UT WoS kapitoly

    001077786900017