Studium potenciálních antisense léčiv: Duplexy 9-merních oligonukleotidů s centrálním mismatchem jako modelový systém pro určování selektivity vazby

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11320%2F04%3A00003131" target="_blank" >RIV/00216208:11320/04:00003131 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/61388963:_____/04:00100810

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Raman Study of Potential 'Antisense' Drugs: Nonamer Oligonucleotide Duplexes with a Central Mismatch as a Model System for the Binding Selectivity Evaluation

Popis výsledku v původním jazyce

A set of four 9-mer oligonucleotide duplexes based on 5 -d(GCATNTCAC)-3 oligonucleotide and four its complements with the central base N=A,C,T,G has been proposed as a model system for the investigation binding selectivity of novel oligonucleotide analogues (candidates for antisense use) to fully complementary sequences. Difference Raman spectra between the mismatch and match duplexes obtained at 15°C exhibited numerous spectral features sensitively indicating the structural changes. All the three mismatches only very weakly disturb the overall B-form conformation of the duplex. Significant structural changes that occurred at the mismatch site are reflected mainly by the neighboring thymidine Raman bands at 1377, 1650, and 1675 cm-1. The intensity change of the two latter bands is almost the same for the T:G and the T:T mismatch while in the case of the T:C mismatch it is just opposite, demonstrating a very different arrangement of the mismatched pair.

Název v anglickém jazyce

Raman Study of Potential 'Antisense' Drugs: Nonamer Oligonucleotide Duplexes with a Central Mismatch as a Model System for the Binding Selectivity Evaluation

Popis výsledku anglicky

A set of four 9-mer oligonucleotide duplexes based on 5 -d(GCATNTCAC)-3 oligonucleotide and four its complements with the central base N=A,C,T,G has been proposed as a model system for the investigation binding selectivity of novel oligonucleotide analogues (candidates for antisense use) to fully complementary sequences. Difference Raman spectra between the mismatch and match duplexes obtained at 15°C exhibited numerous spectral features sensitively indicating the structural changes. All the three mismatches only very weakly disturb the overall B-form conformation of the duplex. Significant structural changes that occurred at the mismatch site are reflected mainly by the neighboring thymidine Raman bands at 1377, 1650, and 1675 cm-1. The intensity change of the two latter bands is almost the same for the T:G and the T:T mismatch while in the case of the T:C mismatch it is just opposite, demonstrating a very different arrangement of the mismatched pair.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

BO - Biofyzika

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA203%2F01%2F1166" target="_blank" >GA203/01/1166: Nové typy oligonukleotidů s neizosterní enzymaticky stabilní fosfonátovou vazbou: Fyzikálně-chemické zhodnocení strukturních variant</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Biopolymers

ISSN

0006-3525

e-ISSN

—

Svazek periodika

74

Číslo periodika v rámci svazku

1-2

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

115-119

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—