Cisplatin Interaction with Cysteine and Methionine in Aqueous Solution: Computational DFT/PCM Study
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11320%2F09%3A00206957" target="_blank" >RIV/00216208:11320/09:00206957 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/60076658:12110/09:00010197
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Cisplatin Interaction with Cysteine and Methionine in Aqueous Solution: Computational DFT/PCM Study
Popis výsledku v původním jazyce
In this paper we explore cisplatin interactions with sulfur-containing amino acids in a polarizable continuum model. Two cisplatin hydrated complexes were considered as reactants (chloro complex, cis- [Pt(NH3)2Cl(H2O)] ; hydroxo complex, cis-[Pt(NH3)2(OH)(H2O)] ). We considered the following reaction mechanism: first step, substitution of the aqua ligand by amino acid; second step, dissociative chelate formation. For the optimized complex (at the B3LYP/6-31 G(d)/COSMO level), the energy profile was determined using the B3LYP/6-311 G(2df,2pd) level and two different PCM modelssCOSMO and UAKS/DPCM methods which were adapted for use on transition metal complexes. The results show thermodynamic preference for bonding by cysteine sulfur followed by the amino group nitrogen, methionine thioether sulfur, and carboxylgroup oxygen.
Název v anglickém jazyce
Cisplatin Interaction with Cysteine and Methionine in Aqueous Solution: Computational DFT/PCM Study
Popis výsledku anglicky
In this paper we explore cisplatin interactions with sulfur-containing amino acids in a polarizable continuum model. Two cisplatin hydrated complexes were considered as reactants (chloro complex, cis- [Pt(NH3)2Cl(H2O)] ; hydroxo complex, cis-[Pt(NH3)2(OH)(H2O)] ). We considered the following reaction mechanism: first step, substitution of the aqua ligand by amino acid; second step, dissociative chelate formation. For the optimized complex (at the B3LYP/6-31 G(d)/COSMO level), the energy profile was determined using the B3LYP/6-311 G(2df,2pd) level and two different PCM modelssCOSMO and UAKS/DPCM methods which were adapted for use on transition metal complexes. The results show thermodynamic preference for bonding by cysteine sulfur followed by the amino group nitrogen, methionine thioether sulfur, and carboxylgroup oxygen.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
BJ - Termodynamika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/IAA400550701" target="_blank" >IAA400550701: Structure and dynamics in complexes of solvated biomolecules</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2009
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Physical Chemistry B
ISSN
1520-6106
e-ISSN
—
Svazek periodika
2009
Číslo periodika v rámci svazku
113
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
12
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000263974900021
EID výsledku v databázi Scopus
—