Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Template-based prediction of ribosomal RNA secondary structure

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11320%2F14%3A10290337" target="_blank" >RIV/00216208:11320/14:10290337 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://ieeexplore.ieee.org/xpl/articleDetails.jsp?tp=&arnumber=6999394" target="_blank" >http://ieeexplore.ieee.org/xpl/articleDetails.jsp?tp=&arnumber=6999394</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1109/BIBM.2014.6999394" target="_blank" >10.1109/BIBM.2014.6999394</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Template-based prediction of ribosomal RNA secondary structure

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Determining the structure of ribosomal RNAs (rRNAs) is one of the crucial steps in understanding the process of protein synthesis, for which rRNAs are one of the basic components. Nevertheless, due to extreme technical difficulties, spatial (3D) structures have been resolved experimentally for only 14 organisms. Also, computational prediction of 3D rRNA structure is almost impossible, and prediction of secondary structure (the list of base pairs in the folded RNA), an important intermediate step betweensequence and 3D structure that is used broadly in modeling of RNA structures, is in the case of rRNAs hindered by both extreme sequence length and high structure complexity. Here we present a proof-of-concept for an rRNA secondary structure prediction method that utilizes known structures as structural templates. Our template-based prediction algorithm determines those regions of the sequence for which structure is being predicted that are conserved well enough so that their secondary s

  • Název v anglickém jazyce

    Template-based prediction of ribosomal RNA secondary structure

  • Popis výsledku anglicky

    Determining the structure of ribosomal RNAs (rRNAs) is one of the crucial steps in understanding the process of protein synthesis, for which rRNAs are one of the basic components. Nevertheless, due to extreme technical difficulties, spatial (3D) structures have been resolved experimentally for only 14 organisms. Also, computational prediction of 3D rRNA structure is almost impossible, and prediction of secondary structure (the list of base pairs in the folded RNA), an important intermediate step betweensequence and 3D structure that is used broadly in modeling of RNA structures, is in the case of rRNAs hindered by both extreme sequence length and high structure complexity. Here we present a proof-of-concept for an rRNA secondary structure prediction method that utilizes known structures as structural templates. Our template-based prediction algorithm determines those regions of the sequence for which structure is being predicted that are conserved well enough so that their secondary s

Klasifikace

  • Druh

    D - Stať ve sborníku

  • CEP obor

    IN - Informatika

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název statě ve sborníku

    Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), 2014 IEEE International Conference on

  • ISBN

    978-1-4799-5669-2

  • ISSN

  • e-ISSN

  • Počet stran výsledku

    3

  • Strana od-do

    17-20

  • Název nakladatele

    IEEE

  • Místo vydání

    Neuveden

  • Místo konání akce

    Belfast, UK

  • Datum konání akce

    2. 11. 2014

  • Typ akce podle státní příslušnosti

    WRD - Celosvětová akce

  • Kód UT WoS článku