Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11320%2F15%3A10312095" target="_blank" >RIV/00216208:11320/15:10312095 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://siret.ms.mff.cuni.cz/p2rank" target="_blank" >http://siret.ms.mff.cuni.cz/p2rank</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    P2RANK

  • Popis výsledku v původním jazyce

    P2RANK is a novel machine learning-based method for prediction of ligand binding sites from protein structure. P2RANK uses Random Forests classifier to infer ligandability of local chemical neighborhoods near the protein surface which are represented byspecific near-surface points and described by aggregating physico-chemical features projected on those points from neighboring protein atoms. The points with high predicted ligandability are clustered and ranked to obtain the resulting list of binding site predictions.

  • Název v anglickém jazyce

    P2RANK

  • Popis výsledku anglicky

    P2RANK is a novel machine learning-based method for prediction of ligand binding sites from protein structure. P2RANK uses Random Forests classifier to infer ligandability of local chemical neighborhoods near the protein surface which are represented byspecific near-surface points and described by aggregating physico-chemical features projected on those points from neighboring protein atoms. The points with high predicted ligandability are clustered and ranked to obtain the resulting list of binding site predictions.

Klasifikace

  • Druh

    R - Software

  • CEP obor

    IN - Informatika

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GP14-29032P" target="_blank" >GP14-29032P: Efektivní explorace chemického prostoru s využitím vícekriteriální optimalizace</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2015

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Interní identifikační kód produktu

    prank_2.0

  • Technické parametry

    stand-alone konzolová aplikace

  • Ekonomické parametry

    Free academic software

  • IČO vlastníka výsledku

    00216208

  • Název vlastníka

    Univerzita Karlova v Praze