Spectroscopic Study of Cytosine Methylation Effect on Thermodynamics of DNA Duplex Containing CpG Motif
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11320%2F15%3A10316952" target="_blank" >RIV/00216208:11320/15:10316952 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1155/2015/842810" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1155/2015/842810</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1155/2015/842810" target="_blank" >10.1155/2015/842810</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Spectroscopic Study of Cytosine Methylation Effect on Thermodynamics of DNA Duplex Containing CpG Motif
Popis výsledku v původním jazyce
Effect of cytosine methylation on DNA duplexes was studied by using a model system of three self-complementary DNA octamers containing central CpG motif surrounded by a couple of AT base pairs, CAACGTTG, CATCGATG, and CTTCGAAG, and their analogues with the central cytosine methylated at C5 position. Temperature dependences of H-1 NMR, UV absorption, and Raman scattering spectra measured for aqueous solutions at concentrations of different orders of magnitude were subjected to a joint analysis that allowed an accurate determination of the enthalpy and entropy of duplex formation. It was revealed that the changes of the enthalpy and entropy contributions are strongly dependent on the base composition in the vicinity of the CpG motif.
Název v anglickém jazyce
Spectroscopic Study of Cytosine Methylation Effect on Thermodynamics of DNA Duplex Containing CpG Motif
Popis výsledku anglicky
Effect of cytosine methylation on DNA duplexes was studied by using a model system of three self-complementary DNA octamers containing central CpG motif surrounded by a couple of AT base pairs, CAACGTTG, CATCGATG, and CTTCGAAG, and their analogues with the central cytosine methylated at C5 position. Temperature dependences of H-1 NMR, UV absorption, and Raman scattering spectra measured for aqueous solutions at concentrations of different orders of magnitude were subjected to a joint analysis that allowed an accurate determination of the enthalpy and entropy of duplex formation. It was revealed that the changes of the enthalpy and entropy contributions are strongly dependent on the base composition in the vicinity of the CpG motif.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
BO - Biofyzika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA13-26526S" target="_blank" >GA13-26526S: Nové DNA a RNA oligonukleotidy s fosfonothioátovými a fosfonoamidátovými internukleotidovými vazbami</a><br>
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Spectroscopy
ISSN
2314-4920
e-ISSN
—
Svazek periodika
2015
Číslo periodika v rámci svazku
2015
Stát vydavatele periodika
EG - Egyptská arabská republika
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000360755300001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-84941126144