Traveler

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11320%2F16%3A10328144" target="_blank" >RIV/00216208:11320/16:10328144 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://github.com/rikiel/TRAVeLer" target="_blank" >https://github.com/rikiel/TRAVeLer</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Traveler

Popis výsledku v původním jazyce

Traveler is a tool enabling visualization of RNA secondary structure using existing well-defined layout of sufficiently similar RNA structure as a template. Traveler is based on an algorithm which first converts both structures into a tree representation and then uses tree edit distance algorithm to find out minimum sequence of tree edit operations to convert one structure into the other. It couples each tree edit operation with a layout modification operation which is then used to gradually transform the known, template, layout into the target one. Traveler is thus a software tool which accepts a pair of secondary structures and the template image and outputs the target visualization.

Název v anglickém jazyce

Traveler

Popis výsledku anglicky

Traveler is a tool enabling visualization of RNA secondary structure using existing well-defined layout of sufficiently similar RNA structure as a template. Traveler is based on an algorithm which first converts both structures into a tree representation and then uses tree edit distance algorithm to find out minimum sequence of tree edit operations to convert one structure into the other. It couples each tree edit operation with a layout modification operation which is then used to gradually transform the known, template, layout into the target one. Traveler is thus a software tool which accepts a pair of secondary structures and the template image and outputs the target visualization.

Druh

R - Software

CEP obor

IN - Informatika

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA15-00885S" target="_blank" >GA15-00885S: Nové metody pro předpověď a vizualizaci sekundárních struktur ribozomálních ribonukleových kyselin - integrované řešení</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

Traveler 1.0

Technické parametry

command line application, c++

Ekonomické parametry

Free academic software

IČO vlastníka výsledku

00216208

Název vlastníka

Univerzita Karlova v Praze