Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F04%3A00012101" target="_blank" >RIV/00216224:14110/04:00012101 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitními proteiny
Popis výsledku v původním jazyce
Bylo zkonstruováno 16 hybridních proteinů kolicinů U/Y. Byly nalezeny 3 aminokyselinové zbytky hrající klíčovou roli v interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem a 4 aminokyselinové zbytky důležité pro tutéž interakci u kolicinu Y. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem jsou klíčové aminokyselinové zbytky F576, G580 a L594. Další interakční místo se nachází v pozici 590-592 (L590, A591, V592). Oproti tomu pro interakci kolicinu Y s jeho imunitním proteinem jsou významné jiné aminokyselinové zbytky, a to Y586, V590, A594 a A595. Menší význam v této interakci má i některá z 34 aminokyselin C-konce kolicinu Y (z nichž 12 je rozdílných oproti kolicinu U). Aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y interagující s příslušnými imunitními proteinyjsou lokalizovány do hydrofobní sekvence mezi helixy 8 a 9 kolicinové domény vytvářející kanál v plazmatické membráně.
Název v anglickém jazyce
Hybrid colicin U/Y Molecules and their interactyion with immunity proteins
Popis výsledku anglicky
Sixteen hybrid U/Y proteins were constructed. Three amino acid residues of colicin U and four amino acid residues of colicin Y were found to be important for interaction with cognate immunity proteins. The amino acid residues F576, G580 and L594 were found to be involved in the interaction between colicin U and its immunity protein. Another interaction region is located in the position 590-592. The amino acid residues Y586, V590, A594 and A595 were identified in recognition of colicin Y by its cognate immunity protein. In addition, one of the 34 amino acids in colicin Y C-terminal region (12 amino acids are different when compared to sequence of colicin U) had a slight effect in the recognition of colicin Y with its immunity protein. Important amino acid residues of colicin U and Y interacting with cognate immunity proteins were found to be located in the hydrophobic sequence between helices 8 and 9 in the colicin pore-forming domain.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA310%2F03%2F1091" target="_blank" >GA310/03/1091: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2004
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Sborník abstraktů XIII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2004
ISBN
—
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
1
Strana od-do
14
Název nakladatele
Lékařská fakulta MU
Místo vydání
Brno
Místo konání akce
Brno, Komenského nám. 2
Datum konání akce
2. 6. 2004
Typ akce podle státní příslušnosti
CST - Celostátní akce
Kód UT WoS článku
—