Restrikční profil genomů vybraných zástupců rodu Treponema
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F04%3A00012108" target="_blank" >RIV/00216224:14110/04:00012108 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Restrikční profil genomů vybraných zástupců rodu Treponema
Popis výsledku v původním jazyce
Byl získán restrikční profil 52 oblastí (69 % genomu) u studovaných treponemálních kmenů. U dvou oblastí (TPI8 a TPI48) byla zjištěna delece v genomu T. paraluiscuniculi. Delece v TPI8 je přibližně 200 bp velká a nachází se v nekódující oblasti. Delece vTPI48 je velká přibližně 2,7 kb a zahrnuje 4 geny tprI, tprJ a dva geny kódující oblasti o neznámé funkci. U jedné oblasti (TPI2) byla nalezena inzerce o velikosti přibližně 150 bp v genomu T. paraluiscuniculi. U 16 TPI oblastí byl nalezen odlišný restrikční profil: u 2 oblastí T. pallidum subsp. pertenue Samoan D a u 15 oblastí T. paraluiscuniculi. Rozdílného restrikčního profilu v oblasti TPI80 (jak u kmene Samoan D, tak a u T. paraluiscuniculi) při štěpení Xba I bylo využito k jejich odlišení od ostatních kmenů. U zbývajících oblastí byl nalezen stejný restrikční profil pro jednotlivá štěpení příslušnými restrikčními enzymy. Výsledky naznačují vysokou míru sekvenční homologie mezi vyšetřenými kmeny. Ačkoliv je patogenita studovaných
Název v anglickém jazyce
Genomic restriction profiles of the selected strains of the genus Treponema
Popis výsledku anglicky
Genomes of T. pallidum subsp. pallidum and closely related treponemes were amplified using XL PCR and digested with BamH I, EcoR I a Hind III (or Spe I, Xba I a Xho I). Genetic differences were identified and discussed.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2004
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Bulletin Československé společnosti mikrobiologické
ISSN
0009-0646
e-ISSN
—
Svazek periodika
XXXXV
Číslo periodika v rámci svazku
A
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
1
Strana od-do
275
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—