Treponema pallidum ssp. pallidum a její detekce v klinickém materiálu.
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F08%3A00025298" target="_blank" >RIV/00216224:14110/08:00025298 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00159816:_____/08:#0000352
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Treponema pallidum ssp. pallidum a její detekce v klinickém materiálu.
Popis výsledku v původním jazyce
Metodou nested PCR detekující gen tmpC a polA bylo celkem nalezeno 40 pozitivních vzorků od 27 pacientů včetně 2 novorozenců. Ze 73 vyšetřovaných stěrů bylo nalezeno 22 pozitivních stěrů od 16 pacientů a z 46 vzorků plné krve bylo pozitivních 16 od 15 pacientů. Z toho u 2 novorozenců s kongenitální syfilis byly nalezeny čtyři PCR pozitivní klinické vzorky. U jednoho dítěte byla prokázána PCR pozitivita u plné krve a u druhého byly zachyceny 3 pozitivní klinické izoláty ze séra, stěru a likvoru. U 22 z 40 pozitivních vzorků byla úspěšná typizace alespoň v 1 z lokusů TP136 nebo TP548 a bylo tak získáno 6 vzorků sekvenčně unikátních a 16 vzorků shodných s popsaným kmenem SS14. V případě typizování více vzorků od téhož pacienta byly nalezeny shodné výsledky.
Název v anglickém jazyce
Detection of Treponema pallidum in clinical material
Popis výsledku anglicky
Nested PCR detecting tmpC and polA genes was employed to discover 40 PCR positive samples from 27 patients including 2 newborns. Out of total 73 lesion swabs, 22 was PCR positive (coming from 16 patients). Among 46 whole blood samples, 16 were PCR positive (from 15 patients). 4 samples were PCR positive in 2 newborns with congenital syphilis. One newborn was PCR positive in the sample of whole blood and the second one was PCR positive in serum, lesion swab and cerebrospinal fluid. In 22 out of 40 samples containing treponemal DNA, typing of at least one of two loci (TP0136 or TP0548) was succesful and 6 unique sequences were discovered. Remaining 16 samples showed sequences identical to SS14 strain. There was complete concordance of multiple samples collected from the same patient where applicable.
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2008
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů