Association of JAK-STAT pathway related genes with lymphoma risk: results of a European case-control study (EpiLymph)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F11%3A00055283" target="_blank" >RIV/00216224:14110/11:00055283 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00209805:_____/11:#0000160

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2141.2011.08632.x" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2141.2011.08632.x</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2141.2011.08632.x" target="_blank" >10.1111/j.1365-2141.2011.08632.x</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Association of JAK-STAT pathway related genes with lymphoma risk: results of a European case-control study (EpiLymph)

Popis výsledku v původním jazyce

Previous studies have suggested an important role for the Janus kinase-signal transducer and activator of transcription (JAK-STAT) signalling pathway in tumour development. Therefore, we explored genetic variants in JAK-STAT pathway associated genes withlymphoma risk. In samples of the EpiLymph case-control study we genotyped 1536 single nucleotide polymorphisms (SNPs) using GoldenGate BeadArray (TM) Technology (Illumina, San Diego, CA, USA). Here, we report the associations between selected SNPs and haplotypes of the JAK-STAT pathway and risk of Hodgkin lymphoma (HL), B-cell non-Hodgkin lymphoma (B-NHL) and most frequent B-NHL subtypes. Among 210 relevant JAK-STAT pathway-related SNPs, polymorphisms in nine genes (BMF, IFNG, IL12A, SOCS1, STAT1, STAT3, STAT5A, STAT6, TP63) were significantly associated with lymphoma risk. At a study-wise significance level, we obtained a risk reduction of 28% among carriers of the heterozygous genotype of the STAT3 variant (rs1053023) for B-NHL.

Název v anglickém jazyce

Association of JAK-STAT pathway related genes with lymphoma risk: results of a European case-control study (EpiLymph)

Popis výsledku anglicky

Previous studies have suggested an important role for the Janus kinase-signal transducer and activator of transcription (JAK-STAT) signalling pathway in tumour development. Therefore, we explored genetic variants in JAK-STAT pathway associated genes withlymphoma risk. In samples of the EpiLymph case-control study we genotyped 1536 single nucleotide polymorphisms (SNPs) using GoldenGate BeadArray (TM) Technology (Illumina, San Diego, CA, USA). Here, we report the associations between selected SNPs and haplotypes of the JAK-STAT pathway and risk of Hodgkin lymphoma (HL), B-cell non-Hodgkin lymphoma (B-NHL) and most frequent B-NHL subtypes. Among 210 relevant JAK-STAT pathway-related SNPs, polymorphisms in nine genes (BMF, IFNG, IL12A, SOCS1, STAT1, STAT3, STAT5A, STAT6, TP63) were significantly associated with lymphoma risk. At a study-wise significance level, we obtained a risk reduction of 28% among carriers of the heterozygous genotype of the STAT3 variant (rs1053023) for B-NHL.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

FP - Ostatní lékařské obory

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

British Journal of Haematology

ISSN

0007-1048

e-ISSN

—

Svazek periodika

153

Číslo periodika v rámci svazku

3

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

16

Strana od-do

318-333

Kód UT WoS článku

000289364700003

EID výsledku v databázi Scopus

—