Hodnocení kometové analýzy s počítačovou podporou - opakovatelnost a reprodukovatelnost dat
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F14%3A00078573" target="_blank" >RIV/00216224:14110/14:00078573 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Hodnocení kometové analýzy s počítačovou podporou - opakovatelnost a reprodukovatelnost dat
Popis výsledku v původním jazyce
Metoda kometové analýzy je založena na migraci poškozené DNA jednotlivých buněk při elektroforéze v agarózovém gelu, její následné vizualizaci (migrující poškozená DNA v gelu vytváří obraz podobný kometě) a hodnocení parametrů poškození DNA. VizualizaciDNA (komet) lze provádět fluorescenčními barvivy nebo stříbřením. Hodnocení je možné buď počítačovými programy založenými na analýze obrazu, případně členěním do kategorií (např. 0?4) dle míry poškození. V naší práci jsme studovali opakovatelnost a reprodukovatelnost výsledků při použití kombinace alkalickoneutrální kometové analýzy, barvení stříbřením a vyhodnocení s pomocí počítačové podpory.
Název v anglickém jazyce
Evaluation of Computer-Assisted Comet Assay - Repeatability and Reproducibility of Data
Popis výsledku anglicky
Evaluation of the alkaline/neutral comet assay combined with Ag staining and computer analysis were performed and afford good repeatability and reproducibility. The present study showed that if an appropriate number of comet results (N=100) is evaluatedusing LUCIA image analysis, there are no statistically significant differences among operators of various levels of experience. Using public domain software CASP, the results showed a consistent tendency to provide lower average values for the studied variable (% tail DNA) compared with LUCIA software. Yet, this tendency was shown to be statistically insignificant for a majority of comets. If limited to a sub-sample of less damaged comets, the software comparison was statistically significant. This together with the fact that CASP was unable to process heavily damaged comets (>90 % tail DNA) may bring certain limitations to the use of CASP combined with presented protocol.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Chemické listy
ISSN
0009-2770
e-ISSN
—
Svazek periodika
108
Číslo periodika v rámci svazku
12
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
1149-1152
Kód UT WoS článku
000346508000009
EID výsledku v databázi Scopus
—